Phylogenetic profile
:
SigK
Orthologous information of transcription factor. (
Explanation
of these marks.)
TF
COG
Orthologs
SigK
-
No ortholog data.
Orthologous information of regulated genes. (
Explanation
of these marks.)
Regulated operon
Regulated gene
Orthologs
cgeAB
cgeA
No ortholog data.
cgeCDE
cgeC
No ortholog data.
cotA
cotA
+
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+
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+
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cotB
cotB
No ortholog data.
cotC
cotC
No ortholog data.
cotD
cotD
No ortholog data.
cotE
cotE
No ortholog data.
cotF
cotF
*
+
*
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+
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cotG
cotG
No ortholog data.
cotH
cotH
+
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cotM
cotM
*
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+
*
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+
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+
+
+
+
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+
cotSA-cotS-ytxO
cotSA
No ortholog data.
cotT
cotT
No ortholog data.
cotVWX
cotV
No ortholog data.
cotVWX
cotX
No ortholog data.
cotYZ
cotY
No ortholog data.
cwlC
cwlC
*
*
+
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*
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+
cwlH
cwlH
No ortholog data.
rnc-smc-ftsY
ftsY
+
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*
*
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gerE
gerE
*
*
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*
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+
gerPABCDEF
gerPA
No ortholog data.
spoIVCB-spoIIIC
spoIVCB
*
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+
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+
+
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spoVFAB-asd-dapG-dapA
spoVFA
No ortholog data.
spoVK
spoVK
*
+
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*
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*
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sps
spsA
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+
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+
+
+
+
+
+
+
sspG-yurS
sspG
No ortholog data.
tgl
tgl
No ortholog data.
yabG
yabG
No ortholog data.
ycsFGI-kipIAR-ycsK
ycsK
+
+
+
+
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ydgBA-cotP
ydgB
No ortholog data.
yfhP
yfhP
*
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yfnHGFED
yfnE
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+
+
+
+
+
+
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+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
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+
+
+
+
+
+
+
yfnHGFED
yfnH
+
+
+
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+
+
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+
+
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+
+
+
+
+
+
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+
yhcOP
yhcO
No ortholog data.
yhjR
yhjR
+
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yitBA-yisZ
yitB
+
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+
+
+
+
+
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+
+
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+
+
yitCD
yitC
+
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+
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+
+
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+
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+
yjcB-yjcZ-spoVIF
yjcB
No ortholog data.
yjcB-yjcZ-spoVIF
yjcC
No ortholog data.
yjcB-yjcZ-spoVIF
yjcZ
No ortholog data.
ykuD
ykuD
+
*
+
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*
*
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ykvPQ
ykvP
+
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*
*
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*
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ylbDE
ylbD
No ortholog data.
ymaG
ymaG
No ortholog data.
yndL
yndL
+
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yngK
yngK
+
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yoaN
yoaN
*
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yobW
yobW
No ortholog data.
yodHI
yodH
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+
+
+
yozR
yozR
No ortholog data.
ypqA
ypqA
No ortholog data.
yqfQ
yqfQ
No ortholog data.
yrkC
yrkC
+
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ysnD
ysnD
No ortholog data.
ytaA
ytaA
No ortholog data.
ytcC
ytcC
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ytlABCD
ytlA
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+
+
+
ywrJ
ywrJ
No ortholog data.
yxeE
yxeE
No ortholog data.
Copyright: Human Genome Center, Inst. Med. Sci., Univ. Tokyo; 1999-2008
Contact:
Kenta Nakai
