Similar regions between promoters of ydfE
<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub TGTAATACCGATGTCTCCCATGCTTCTCTACGCTAATCAGCTTTGCTTCAAGCAATTTAT hal .....TAACGATGTCGGCCTTGCTTTTCAACAGCGACGAGATGAGCTTCTACCATTTTCG -300 -290 -280 -270 -260 -250 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub TCAGGTGAAAACTTGCAGTTTGAGGTTTAATGTTAGCGAGATATGCAAGCTCTCCCGCAG hal TTAGGTGAAAGCTAGCCGTTTGTGGTGTAATGTTAGCCGCTAATGCGAGCTCTGTCGCGG -240 -230 -220 -210 -200 -190 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub GGTGTATCCTTCCATCCATCAGACTGAGAAGAATGGAAGAACGCGAGGGATCTGATAGCA hal TGTGGAAGCGTCCATCTAATAAAACGGTCATCATCGCCCCACGAGAATCATCGCTCACAA -180 -170 -160 -150 -140 -130 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub ACGAAGAGATTTTTGCAATATTAGGATTCATGATTTTCC----TCCTTACATTC-ATATT hal GCGAAGCGACAAGGGATAGGTTTGTATGCTGCATAATCCAGCCTCCTTGTATTCCATACT -120 -110 -100 -90 -80 -70 sub TCGATGATAGTTGAAATGTTAATCCTTTACAATATAAATGTAAGCGTGACAAGGAGGAAA hal TCGATGATAGTTGAAATATCAATCAATTACAATA.......................... -60 -50 -40 -30 -20 -10 sub AAACG hal ..... -1 > : other CDS - : gaps within a similar region ] : terminator . : gaps between similar regions } : RNAs @ : known binding sites <,[,{ : opposite direction About alignment...