Similar regions between promoters of yhcT
<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub TTAATGTTCCTTGGTAATAATGGTTATTTAAAGACAGAACGCCTTTCTTTTTCAAGCGCT ste ................ATGTTCGTGATCTAACGAAAGAATGCCCCACTCCTCAAATTGAC -300 -290 -280 -270 -260 -250 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< <<<< sub GAATGTCCAGTTCGGAGAAATAAAGAGGAAATACATCATGGATCAGCTCCATAGA-CAGC ste GGATTTGTTCATCATCGAAGTAATACGGGAACACATCG-GTATAAAAGTAGTTGAGCAAA -240 -230 -220 -210 -200 -190 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< <<<<<<< < sub TCCTTGATAAAGCTCTCCTGTTCTGCAGTTGCTGCGTTCACAATTCTCA-CGTCAAT--C ste TACTGCATGTAATGCTCTTGTTCCGGAGTCGCTGCATACATCATTTTCAACGTCCATACC -180 -170 -160 -150 -140 -130 <<<<<< <<<<<<<< sub ACCTTT-CTTGCCATCGAATATCCTAAGTCTTACTCAAGAATAGCAC-AGAAAAAAACGC ste ACCTTTTCTCGCC...GAGTGTACCATATCTCGCGCAAGGATAGGGGTAGAAAGTGTTTC -120 -110 -100 -90 -80 -70 sub GAAAGCTAAGGTAAGTGTTTCCTATGAGAAACAGCAGCCTTCCGCTTCGAAAAGGAGCCA ste CACAGCTAA.GAAAGTGTTTCC...................................... -60 -50 -40 -30 -20 -10 sub TTTAAC ste ...... -1 > : other CDS - : gaps within a similar region ] : terminator . : gaps between similar regions } : RNAs @ : known binding sites <,[,{ : opposite direction About alignment...