Similar regions between promoters of ylaM
<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub TAATGTAGGCGGCGCGATTCGCCCCTCTCTGATGACGCGTTCCGGATCAAGGTCGGATTC hal ............................................................ ste ...TGGAAGAAGGGAGATTCCGCCATCAAGGAATGTACGTCCGCGAT---GATACGATTC -300 -290 -280 -270 -260 -250 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub ATCCCCGGCTGATTGTAAATATGTGTCTTGACTGTCCCCTTTGCGGTCAAACGAAAATTT hal ...............TGAATCGGTCTCCTTTCTGTCGCCTTTTAGTATAAGCG..ACTTT ste CTGTCCGCATGTTT..........................................ATTT -240 -230 -220 -210 -200 -190 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub GCGATCATCAAAAATCCATACGCTTGGATCAATGGTAATTGGATATGTAACATTGCCTTT hal TCGTTCGTCAAAAATCCAAACGGTTGGGTCAATGGTTAGTGGATGGTTCACGTTTCCTT. ste GCGATC..............................................TTGCGATC -180 -170 -160 -150 -140 -130 <<<<<<<<<<<<<<<<<< sub TACTTGGATAACGCTCATGATATGACCCCCTTCTCTCAAAATTATAAAAGTTTTCGCATG hal ............................CCTTCAATAAAAAATACAAAC-TCTTC-CATG ste GAATTGAAAAACG......................TCGAATTGAAAAACGTATTTGC... -120 -110 -100 -90 -80 -70 sub AATTGTCACTTTGTGTACAAATTATGTGTATTGAAATGCTGAGGGAACGAGGGTGTTTGC hal AATCG....................................................... ste .......................................TGCTGGAAGAAGGGAGATTCC -60 -50 -40 -30 -20 -10 -1 > : other CDS - : gaps within a similar region ] : terminator . : gaps between similar regions } : RNAs @ : known binding sites <,[,{ : opposite direction About alignment...