Phylogenetic profile
:
SigA
Orthologous information of transcription factor. (
Explanation
of these marks.)
TF
COG
Orthologs
SigA
COG0568
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
Orthologous information of regulated genes. (
Explanation
of these marks.)
Regulated operon
Regulated gene
Orthologs
abnA
abnA
*
+
*
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
abrB
abrB
*
*
*
.
.
.
.
*
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
ackA
ackA
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
+
+
+
.
+
+
+
.
+
+
.
.
+
+
+
+
.
+
+
+
acsA
acsA
*
*
.
+
.
.
+
+
.
.
.
.
.
+
+
.
*
*
*
*
+
.
+
+
.
*
+
.
.
+
+
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
*
*
.
.
+
acuABC
acuA
No ortholog data.
adaAB
adaA
+
+
.
+
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
addBA
addB
+
+
*
+
+
+
*
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
ahpCF
ahpC
*
*
.
+
*
.
+
*
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
+
*
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
*
+
*
+
ald
ald
*
*
.
*
.
.
*
+
.
.
.
.
.
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
*
.
.
+
.
+
+
.
.
.
.
.
.
*
*
.
.
.
+
*
*
*
*
*
*
*
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
*
.
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
.
*
*
+
.
+
+
alkA
alkA
+
+
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
+
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
+
alsSD
alsS
*
+
*
*
.
*
+
*
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
+
amhX
amhX
*
+
*
+
.
+
*
+
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
.
.
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
*
+
amyE
amyE
+
*
+
*
+
+
+
*
*
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
*
+
.
+
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
.
+
*
.
*
.
+
ansAB
ansA
*
+
+
+
*
*
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
*
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
antE
antE
No ortholog data.
aprE
aprE
*
*
*
.
*
*
.
.
+
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
.
+
+
.
.
*
*
*
+
.
.
+
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
aprX
aprX
+
+
+
.
+
+
.
.
+
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
.
+
+
.
.
+
+
+
+
.
.
+
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
araABDLMNPQ-abfA
araA
*
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
araE
araE
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
.
+
+
+
+
*
*
*
+
*
+
+
*
*
+
+
+
+
+
*
*
*
+
+
+
*
+
*
*
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
araR
araR
*
*
*
*
*
*
+
*
+
.
.
.
+
+
+
.
*
+
+
*
+
.
+
+
+
*
+
.
.
+
.
.
.
+
+
*
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
*
+
arfM
arfM
No ortholog data.
argCJBD-carAB-argF
argC
*
+
*
*
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
*
+
+
.
+
arsR-yqcK-arsBC
arsR
No ortholog data.
spoVFAB-asd-dapG-dapA
asd
+
+
*
*
.
*
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
*
.
+
+
+
*
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
bglC
bglC
*
+
*
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
*
.
.
bglPH-yxiE
bglP
*
*
*
+
*
*
+
*
+
+
+
.
+
.
.
.
+
*
*
+
+
+
+
+
.
*
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
*
.
*
*
*
+
*
*
+
*
+
+
+
+
+
.
.
.
+
*
*
+
+
+
+
+
.
*
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
*
.
*
*
*
+
*
*
+
*
+
+
+
.
+
.
.
.
+
*
*
+
+
+
+
+
+
*
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
*
.
licT-bglS
bglS
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
blt-bltD
blt
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
bmrU-bmr-bmrR
bmr
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
bsrB
bsrB
No ortholog data.
ccdA-yneIJ
ccdA
*
+
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
+
.
+
+
+
+
+
+
ykuJK-ykzF-ykuL-ccpC
ccpC
No ortholog data.
cdd-era
cdd
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
*
+
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
*
.
.
.
+
.
+
cggR-gapA-pgk-tpiA-pgm-eno
cggR
No ortholog data.
citA
citA
*
*
.
+
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
*
.
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
.
+
citB
citB
+
.
+
+
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
.
.
+
citG
citG
+
+
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
.
+
citM-yflN
citM
+
+
.
.
+
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
+
+
+
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
citR
citR
*
*
*
*
*
+
*
*
.
.
.
.
+
+
+
+
*
*
*
*
*
.
*
+
*
*
+
*
*
+
.
.
+
*
+
*
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
citZ-icd-mdh
citZ
*
*
.
+
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
*
.
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
.
+
clpE
clpE
*
*
*
*
*
*
*
+
.
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
*
+
*
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
*
+
+
+
+
*
+
*
+
clpP
clpP
*
+
+
*
*
*
*
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
*
+
+
+
+
+
+
+
+
clpX
clpX
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
codV-clpQY-codY
codV
+
+
+
.
.
.
+
*
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
comA-yuxO
comA
+
+
+
+
+
+
*
+
.
.
.
.
+
+
+
.
*
*
*
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
*
*
.
.
.
+
comC
comC
+
+
+
+
+
+
*
+
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
+
comEABC
comEA
+
+
*
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
comFABC-yvyF-flgM-yvyG-flgKL
comFA
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
comGABCDEFG-yqzE
comGA
*
+
*
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
+
+
.
.
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
comK
comK
+
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
comQX
comQ
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
*
*
+
+
*
*
+
+
*
*
*
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
*
+
csbA
csbA
+
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
cspB
cspB
*
*
*
*
+
.
*
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
*
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
*
+
.
.
.
.
.
.
+
*
+
+
cssRS
cssR
No ortholog data.
ctaA
ctaA
*
+
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
+
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
*
+
.
.
.
.
+
+
+
.
.
+
ctsR-mcsAB-clpC-radA-yacK
ctsR
+
*
*
+
+
+
+
*
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
cydABCD
cydA
+
+
.
+
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
.
.
.
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
.
.
.
cysHP-sat-cysC-ylnDEF
cysH
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
*
+
cysK
cysK
+
+
+
*
+
*
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
dctSRP
dctP
No ortholog data.
degQ
degQ
No ortholog data.
degSU
degS
*
+
+
+
+
+
*
+
.
.
.
.
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
+
des
des
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
+
+
*
*
+
+
+
+
+
*
.
*
*
*
+
*
*
*
+
.
.
+
*
+
+
*
+
.
.
.
.
.
.
+
*
+
*
*
+
dhbACEBF
dhbA
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
+
*
*
+
*
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
*
+
+
.
.
+
*
+
+
*
+
murE-mraY-murD-spoVE-murG-murB-divIB-ylxWX-sbp
divIB
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
*
*
*
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
.
.
.
+
dnaAN
dnaA
+
+
+
*
*
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
*
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
lepA-hemN-hrcA-grpE-dnaKJ-yqeTUV
dnaJ
*
+
*
*
+
+
+
+
*
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
dppABCDE
dppA
+
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
deoR-dra-nupC-pdp
dra
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
.
.
.
.
.
+
.
+
+
+
+
.
+
drm-punA
drm
*
+
+
*
*
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
+
ezrA
ezrA
No ortholog data.
fabHAF
fabHA
No ortholog data.
yfhQ-fabL-sspE
fabL
No ortholog data.
fbp
fbp
*
.
*
+
.
.
*
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
feuABC-ybbA
feuA
*
*
+
+
+
*
+
*
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
.
.
.
+
*
*
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
*
.
+
*
+
fla-che
flgB
+
+
+
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
.
.
+
+
.
.
narK-fnr
fnr
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
ftsAZ
ftsA
+
+
*
+
+
+
*
+
.
.
.
.
.
.
.
.
*
*
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
.
.
+
+
+
+
ftsH
ftsH
+
+
*
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
fur
fur
+
*
*
*
+
.
+
*
.
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
*
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
*
*
+
gabP
gabP
+
+
+
*
*
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
gabR
gabR
No ortholog data.
gabTD
gabT
No ortholog data.
galE
galE
+
+
*
+
.
*
.
+
.
+
+
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
.
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
*
+
gapB-speD
gapB
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
gcaD-prs-ctc
gcaD
+
+
*
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
*
+
+
+
*
+
ggaAB
ggaA
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
+
.
+
+
.
+
.
glnRA
glnR
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
*
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
*
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
*
+
glpD
glpD
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
+
glpFK
glpF
+
+
*
*
*
+
+
*
+
+
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
.
*
+
+
+
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
*
+
.
.
*
*
+
glpTQ
glpQ
*
+
+
*
*
+
+
+
*
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
*
+
.
+
+
+
+
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
.
.
+
.
+
*
+
glpTQ
glpT
+
.
.
+
*
.
*
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
gltAB
gltA
+
+
*
+
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
+
.
.
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
+
+
+
*
+
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
+
.
.
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
+
+
+
*
+
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
+
.
.
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
+
gltC
gltC
*
*
*
*
*
+
*
*
.
.
.
.
+
+
+
+
*
*
*
*
*
.
*
+
*
*
+
*
*
+
.
.
+
*
+
*
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
gltR
gltR
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
gltX-cysES-yazC-yacOP
gltX
+
*
*
+
*
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
*
*
*
+
+
+
+
*
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
*
*
+
glyA
glyA
+
+
*
*
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
*
+
+
.
+
gntRKPZ
gntR
+
+
+
*
+
.
*
*
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
*
.
.
.
+
+
+
.
.
.
+
+
+
*
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
*
+
gntRKPZ
gntZ
+
.
.
+
.
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
groESL
groES
+
+
*
*
*
*
+
+
.
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
*
*
*
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
*
+
+
*
+
*
+
gtaB
gtaB
*
+
+
+
*
+
+
*
.
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
+
.
+
+
.
+
.
guaA
guaA
*
+
+
+
*
*
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
.
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
*
*
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
.
+
+
+
+
+
+
+
guaD
guaD
No ortholog data.
gudB
gudB
No ortholog data.
gutBP
gutB
+
*
*
+
*
+
*
*
.
+
.
.
.
+
+
.
+
*
*
+
+
.
+
+
+
.
+
*
+
+
.
.
.
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
*
.
+
gyrA
gyrA
+
+
+
*
+
*
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
hbs
hbs
*
+
+
*
*
*
+
+
+
+
+
*
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
*
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
hemAXCDBL
hemA
*
*
*
.
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
+
+
+
.
+
+
hemZ
hemZ
+
+
+
*
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
*
*
+
*
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
hmp
hmp
+
+
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
+
.
.
+
.
.
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
+
+
+
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
lepA-hemN-hrcA-grpE-dnaKJ-yqeTUV
hrcA
+
+
*
*
*
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
*
+
.
.
*
+
.
+
+
.
htpG
htpG
+
*
*
.
.
.
.
*
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
.
+
.
+
.
+
+
.
.
+
+
+
*
.
.
*
.
htrA
htrA
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
hut
hutP
No ortholog data.
citZ-icd-mdh
icd
No ortholog data.
ilvBHC-leuABCD
ilvB
*
+
*
*
.
*
+
*
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
+
infC-rpmI-rplT-ysdA
infC
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
iolRS
iolR
*
+
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
*
+
+
+
.
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
*
*
+
ispA
ispA
+
+
+
.
+
+
.
.
+
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
.
+
+
.
.
+
+
+
+
.
.
+
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
kdgRKAT
kdgR
*
*
*
*
*
*
+
*
+
.
.
.
+
+
+
.
*
+
+
*
+
.
+
+
+
*
+
.
.
+
.
.
.
+
+
*
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
*
+
kinB-kapB
kinB
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
kinC
kinC
*
*
*
+
+
*
*
*
.
.
.
.
+
+
+
+
*
*
*
+
*
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
*
+
+
*
+
+
+
+
+
.
*
*
*
*
*
+
+
*
*
*
.
.
.
.
*
.
.
.
.
+
+
+
+
*
*
*
+
*
.
+
+
.
.
+
.
.
+
.
.
*
*
+
+
*
+
.
.
+
+
.
*
*
*
*
*
.
+
ldh-lctP
ldh
No ortholog data.
lepA-hemN-hrcA-grpE-dnaKJ-yqeTUV
lepA
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
licBCAH
licB
*
*
+
+
+
*
.
*
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
licR
licR
*
*
*
*
*
*
+
*
+
+
+
.
+
.
.
.
+
*
*
+
+
.
+
+
+
+
.
*
*
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
*
.
*
*
*
*
*
*
+
*
.
.
.
.
+
.
.
.
+
*
*
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
*
.
lmrAB
lmrA
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
lonA-ysxC
lonA
+
+
*
.
.
.
.
.
+
+
+
*
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
*
+
+
+
.
.
+
+
+
+
lrpC
lrpC
+
*
*
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
*
+
*
+
.
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
lysC
lysC
+
+
*
*
.
*
+
*
.
.
.
.
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
.
.
+
+
+
+
.
+
lytABC
lytA
No ortholog data.
lytE
lytE
+
+
+
+
.
.
.
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
.
.
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
.
.
.
+
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
.
.
+
.
.
+
lytR
lytR
+
*
+
*
*
*
*
+
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
*
.
+
.
+
maeN
maeN
No ortholog data.
malA-yfiA-malP
malA
No ortholog data.
mecA
mecA
+
+
.
+
+
*
*
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
med-comZ
med
+
+
+
+
+
+
.
+
*
+
+
*
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
*
.
.
.
.
.
+
+
.
+
.
+
.
+
menBEC
menB
+
.
.
+
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
menBEC
menE
*
*
.
+
*
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
*
+
+
+
*
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
*
+
+
+
+
*
+
+
+
.
.
+
+
.
.
.
+
menBEC
menF
+
.
.
+
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
*
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
mmsA-iolBCDEF-idh-iolHI-fbaB
mmsA
No ortholog data.
mrgA
mrgA
+
+
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
.
+
.
+
+
+
.
.
+
+
+
+
.
.
+
+
mta
mta
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
mtrAB
mtrA
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
nadBCA
nadB
*
*
+
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
+
+
+
+
.
.
.
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
*
.
nadE
nadE
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
*
*
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
*
+
+
+
+
+
+
narGHJI
narG
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
.
+
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
narK-fnr
narK
+
+
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
nasA
nasA
+
*
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
+
*
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
*
.
.
.
nasBCDEF
nasB
+
+
+
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
nfrA-ywcH
nfrA
No ortholog data.
nifS-yrxA
nifS
*
*
*
+
*
+
*
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
*
+
+
*
+
nrgAB
nrgA
*
+
*
*
.
.
+
+
.
.
.
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
*
.
+
ylxS-nusA-ylxRQ-infB-ylxP-rbfA
nusA
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
odhAB
odhA
+
+
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
*
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
+
kinE-ogt
ogt
No ortholog data.
opuAABC
opuAA
+
.
.
+
+
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
opuBABCD
opuBA
+
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
+
+
opuE
opuE
+
+
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
*
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
*
.
.
+
.
.
.
*
.
pabBAC-sul-folBK-yazB-yacF-lysS
pabB
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
pbpD-yuxK
pbpD
+
*
*
*
*
*
*
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
*
*
.
+
+
+
pbpF
pbpF
+
*
*
*
*
*
*
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
*
*
.
+
+
+
pckA
pckA
+
+
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
pdhABCD
pdhA
*
+
.
+
+
+
+
*
*
+
+
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
*
.
.
+
+
.
.
.
+
pdhABCD
pdhC
*
+
.
+
+
+
*
*
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
.
.
.
*
perR
perR
+
*
*
*
+
.
+
*
.
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
*
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
*
*
+
cggR-gapA-pgk-tpiA-pgm-eno
pgk
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
pheST
pheS
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
phoA
phoA
+
+
.
.
.
.
*
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
+
.
.
+
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
+
.
+
phoB-ydhF
phoB
+
+
.
.
.
.
*
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
+
.
.
+
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
+
.
+
phoD
phoD
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
phoPR
phoP
*
*
*
+
*
*
*
+
.
.
.
.
+
+
+
+
*
*
*
*
*
.
+
+
+
+
*
+
+
+
*
*
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
.
.
+
*
+
*
*
+
rapE-phrE
phrE
No ortholog data.
rapI-phrI
phrI
No ortholog data.
pmi
pmi
+
+
+
+
+
*
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
*
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
*
.
+
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
.
+
ppiB
ppiB
+
*
+
*
+
*
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
*
*
*
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
.
*
+
.
.
*
+
pssA-ybfM-psd
pssA
+
+
*
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
*
+
+
+
.
+
.
.
.
.
+
.
pst
pstS
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
pta
pta
+
+
*
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
*
+
.
.
+
+
+
ptsGHI
ptsG
*
*
*
+
*
*
+
*
+
+
+
.
+
.
.
.
+
*
*
+
+
+
+
+
.
*
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
*
.
*
*
*
+
*
*
+
*
+
+
+
+
+
.
.
.
+
*
*
+
+
+
+
+
.
*
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
*
.
*
*
*
+
*
*
+
*
+
+
+
.
+
.
.
.
+
*
*
+
+
+
+
+
+
*
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
*
.
ptsGHI
ptsH
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
pucABCDE
pucA
+
.
*
+
*
+
+
+
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
*
+
.
.
+
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
+
+
pucH
pucH
No ortholog data.
pucRJKLM
pucJ
No ortholog data.
purA
purA
*
*
+
+
+
*
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
purEKBCSQLFMNHD
purE
*
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
purT
purT
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
pyrG
pyrG
No ortholog data.
pyrRPBCAAABKDFE
pyrR
+
+
+
*
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
+
+
qcrABC
qcrA
+
*
*
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
*
+
.
.
+
rapA-phrA
rapA
*
*
*
+
+
+
*
*
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
*
*
*
*
+
*
*
*
*
+
rapB
rapB
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
rapC-phrC
rapC
*
*
*
+
+
+
*
*
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
*
*
*
*
+
*
*
*
*
+
rapD
rapD
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
rapG-phrG
rapG
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
rapH-phrH
rapH
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
rbsRKDACB
rbsR
*
*
*
*
*
*
+
*
+
.
.
.
+
+
+
.
*
+
+
*
+
.
+
+
+
*
+
.
.
+
.
.
.
+
+
*
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
*
+
recA
recA
+
+
*
+
+
+
*
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
*
+
resABCDE
resA
+
*
*
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
*
*
+
+
*
*
+
+
+
*
+
+
+
+
+
*
*
+
+
+
+
+
*
*
+
*
+
resABCDE
resD
*
*
*
+
*
*
*
+
.
.
.
.
+
+
+
+
*
*
*
*
*
.
+
+
+
+
*
+
+
+
*
*
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
.
.
+
*
+
*
*
+
rnc-smc-ftsY
rnc
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
rocR
rocR
+
+
+
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
rpmH
rpmH
+
+
+
*
*
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
*
*
+
+
+
+
+
+
*
*
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
rpoB
rpoB
+
+
*
*
*
*
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
*
ywjF-acdA-rpoE
rpoE
+
+
.
*
*
*
+
*
.
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
rpsD
rpsD
*
*
+
*
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
rrnA-16S-trnA-Ile-trnA-Ala-rrnA-23S-rrnA-5S
rrnA-16S
No ortholog data.
trnB
rrnB-16S
No ortholog data.
rrnD
rrnD-16S
No ortholog data.
rrnO-16S-trnO-Ile-trnO-Ala-rrnO-23S-rrnO-5S
rrnO-16S
No ortholog data.
rsbRSTUVW-sigB-rsbX
rsbR
*
+
+
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
+
.
.
+
+
+
.
+
*
.
*
+
+
sacB-yveBA
sacB
No ortholog data.
sacPA-ywdA
sacP
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
+
.
sacXY
sacX
*
*
*
+
*
*
+
*
+
+
+
.
+
.
.
.
+
*
*
+
+
+
+
+
.
*
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
*
.
*
*
*
+
*
*
+
*
+
+
+
+
+
.
.
.
+
*
*
+
+
+
+
+
.
*
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
*
.
sboAX-albABCDEFG
sboA
No ortholog data.
yaaJ-scr
scr
No ortholog data.
sda
sda
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
+
.
.
.
+
+
.
+
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
sdhCAB
sdhC
*
*
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
*
.
.
+
*
*
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
+
secA-prfB
secA
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
fla-che
sigD
+
+
+
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
.
.
sigH
sigH
*
*
*
+
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
*
+
+
+
+
+
*
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
.
+
+
.
+
+
+
sigM-yhdLK
sigM
No ortholog data.
sigX-rsiX
sigX
*
*
*
+
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
*
+
+
+
+
+
*
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
.
+
+
.
+
+
+
sinIR
sinI
No ortholog data.
sinIR
sinR
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
*
+
+
.
+
+
+
+
+
.
*
+
+
+
*
*
*
*
.
.
.
+
+
+
+
+
*
+
.
.
+
.
.
+
*
*
*
*
sipS
sipS
+
+
+
+
*
+
*
+
*
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
*
+
gapB-speD
speD
No ortholog data.
speE-speB
speE
No ortholog data.
spo0A
spo0A
*
*
*
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
+
.
*
*
*
+
*
.
+
+
+
+
+
.
.
+
*
*
+
*
+
+
+
+
.
.
.
.
*
*
*
*
.
+
.
+
spo0B-obg
spo0B
No ortholog data.
spo0E
spo0E
No ortholog data.
spo0F
spo0F
*
*
*
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
+
.
*
*
*
+
*
.
+
+
+
+
+
.
.
+
*
*
+
*
+
+
+
+
.
.
.
.
*
*
*
*
.
+
.
+
spoIIE
spoIIE
*
+
*
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
+
.
.
.
+
+
+
.
*
*
.
+
+
.
spoIIGA-sigE-sigG
spoIIGA
No ortholog data.
spoIIIE
spoIIIE
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
+
spoIIIJ-jag
spoIIIJ
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
srfAA-srfAB-comS-srfAC-srfAD
srfAA
*
.
.
*
*
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
+
.
.
+
*
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
ssuBACD-ygaN
ssuB
+
+
+
.
.
+
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
+
+
.
.
+
+
.
+
+
+
tagAB
tagA
+
.
+
.
.
.
*
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
+
.
+
+
+
.
.
.
.
+
.
+
+
.
+
.
+
tagDEF
tagD
+
.
.
+
.
.
*
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
tetLB
tetL
No ortholog data.
thrS
thrS
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
*
+
+
*
+
+
+
thrZ-ywhA
thrZ
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
trePAR
treP
*
*
*
+
*
*
+
*
+
+
+
.
+
.
.
.
+
*
*
+
+
+
+
+
.
*
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
*
.
*
*
*
+
*
*
+
*
+
+
+
+
+
.
.
.
+
*
*
+
+
+
+
+
.
*
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
*
.
rrnD
trnD-Asn
No ortholog data.
rrnD
trnD-Leu2
No ortholog data.
trpEDCFBA-hisC-tyrA-aroE
trpE
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
trxA
trxA
+
*
*
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
*
*
+
+
*
*
+
+
+
*
+
+
+
+
+
*
*
+
+
+
+
+
*
*
+
*
+
tuaABCDEFGH
tuaA
+
+
+
.
.
+
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
.
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
tyrS
tyrS
+
+
+
+
*
*
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
ureABC
ureA
*
+
.
.
.
.
+
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
+
+
+
.
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
+
uxaC-yjmBCD-uxuA-yjmF-exuTR-uxaBA
uxaC
No ortholog data.
valS-folC
valS
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
veg
veg
*
*
*
*
+
+
+
*
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
wapA-yxxG
wapA
+
.
+
.
.
.
.
*
.
.
.
.
.
.
.
.
+
*
+
+
+
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
xpt-pbuX
xpt
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
*
*
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
+
*
+
xsa
xsa
+
+
*
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
*
+
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
xylAB
xylA
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
*
.
.
xynA
xynA
+
+
.
+
.
.
+
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
.
.
+
xynPB
xynP
No ortholog data.
yaaA-recF-yaaB-gyrB
yaaA
+
+
+
*
+
+
+
+
+
.
.
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
.
*
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
+
+
yaaA-recF-yaaB-gyrB
yaaB
No ortholog data.
yaaJ-scr
yaaJ
+
+
+
+
.
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
.
.
+
skf
ybcO
No ortholog data.
ybgJ-ybgH
ybgJ
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
+
.
yccC
yccC
*
+
+
+
*
*
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
*
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
ycdHI-yceA
ycdH
+
*
*
+
*
*
*
*
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
+
+
.
.
+
+
+
.
+
+
.
.
.
+
+
+
.
+
.
+
+
+
*
+
.
+
*
+
*
*
+
yceCDEFGH
yceC
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
+
yciABC
yciA
+
+
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
yciABC
yciC
*
+
.
.
.
.
*
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
*
+
.
+
+
.
.
+
+
+
+
+
*
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
*
+
.
+
+
rtpA-ycbK
yczA
No ortholog data.
ydfJ
ydfJ
+
.
+
.
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
ydfK
ydfK
+
+
+
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
ydjK
ydjK
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
yfkJIH
yfkJ
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
.
+
.
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
.
+
yflG-yflH
yflG
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
yfmPO
yfmP
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
*
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
*
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
*
+
yhaG
yhaG
No ortholog data.
yhcL
yhcL
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
.
+
+
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
yhfL
yhfL
+
+
.
+
+
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
.
.
.
+
ntdABC-glcP
yhjL
+
.
+
.
.
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
+
.
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
.
.
.
.
+
.
+
+
+
+
.
.
yjbCD
yjbD
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
+
+
yjcIJ
yjcI
+
*
*
+
*
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
*
*
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
*
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
*
+
yklA
yklA
*
.
.
*
.
.
+
+
.
+
+
.
+
.
.
.
+
+
+
.
+
.
+
+
.
.
+
.
.
+
.
.
.
+
+
+
*
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
ykzB-ykoL
ykoL
No ortholog data.
mtnKA
ykrT
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
mtnU
ykrU
+
+
+
.
.
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
.
+
+
+
+
.
+
mtnV
ykrV
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
mtnWXBD
ykrW
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
ykuFG
ykuF
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
ykuNOP
ykuN
*
.
*
*
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
+
+
.
.
*
.
ykvW
ykvW
*
+
+
*
*
+
+
*
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
*
+
ylaABCD
ylaC
+
+
+
+
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
.
+
+
.
+
+
+
fapR-plsX-fabDG
ylpC
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
+
ylxM-ffh
ylxM
*
*
*
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
*
.
nrdIEF-ymaB
ymaA
+
.
.
+
+
+
+
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
ccdA-yneIJ
yneI
*
*
*
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
+
.
*
*
*
+
*
.
+
+
+
+
+
.
.
+
*
*
+
*
+
+
+
+
.
.
.
.
*
*
*
*
.
+
.
+
ccdA-yneIJ
yneJ
+
*
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
yocH
yocH
+
+
+
+
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
.
.
.
+
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
.
.
+
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
+
ypuE-ribDEAHT
ypuE
No ortholog data.
txpA
yqdB
No ortholog data.
yqxD-dnaG-sigA
yqxD
+
+
+
.
.
.
+
*
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
yqxM-sipW-tasA
yqxM
No ortholog data.
yrrT-mtn-yrhABC
yrrT
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
cymR-yrvO-trmU
yrzC
+
+
+
+
.
+
+
+
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
lcfA-ysiAB-etfBA
ysiA
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
ytkD
ytkD
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
+
+
+
+
*
*
*
+
+
+
+
+
+
+
*
*
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
*
+
+
*
+
ytlI
ytlI
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
ytmIJKLMNO-ytnIJ-ribR-ytnLM
ytmI
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
ytrABCDEF
ytrA
+
*
*
.
+
*
+
*
.
.
.
.
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
*
.
.
yurHG
yurH
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
.
+
+
+
+
yusMLKJ
yusL
+
+
+
.
+
+
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
+
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
yuxH
yuxH
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
sdpRI
yvbA
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
eps
yveK
+
+
+
.
.
+
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
yvgRQ
yvgR
*
*
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
.
.
.
.
+
.
+
.
+
.
.
+
+
.
.
*
+
.
.
.
.
ywbI-thiME
ywbI
*
*
*
*
*
+
*
*
.
.
.
.
+
+
+
+
*
*
*
*
*
.
*
+
*
*
+
*
*
+
.
.
+
*
+
*
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
ywcJ
ywcJ
+
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
ywfK
ywfK
*
*
*
*
*
+
*
*
.
.
.
.
+
+
+
+
*
*
*
*
*
.
*
+
*
*
+
*
*
+
.
.
+
*
+
*
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
ywjF-acdA-rpoE
ywjF
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
ywkAB
ywkA
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
.
+
.
+
ywoE
ywoE
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
yxeKLMNOPQ
yxeK
+
+
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
+
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
Copyright: Human Genome Center, Inst. Med. Sci., Univ. Tokyo; 1999-2005
Contact:
Kenta Nakai
