Phylogenetic profile : SigE

Orthologous information of transcription factor. (Explanation of these marks.)
TF COG Orthologs
SigE COG1191 +++...++.....++.+++++.++.....++++.......+++.++++..

Orthologous information of regulated genes. (Explanation of these marks.)
Regulated operon Regulated gene Orthologs
asnO asnO ++++...+....+++++++++.++..+.......+.+.............
bdbDC bdbD No ortholog data.
bofA bofA No ortholog data.
cotE cotE No ortholog data.
cotJABC-yesJK cotJA No ortholog data.
ctaA ctaA ++....++....++++.......+..+..+...+++++++....+++..+
ybaK-cwlD cwlD *++...++....++++++++++++++++++++++++++..+++++*+.++
cwlJ cwlJ *++..............................+++++............
dacB-spmAB dacB ****+++*....+++++++*+.++++++++...+++++++++++....+.
gerM gerM ++........................................++++....
glgBCDAP glgB +....+......+++.+++++.++++...+...++.+...++..+++.++
mmgABCDE-yqiQ mmgA *++++.*+....++++++++*.+++....+++.+++++++...*+...++
nucB nucB No ortholog data.
phoB-ydhF phoB ++....+.....+...+++*...+..+..+.....+.........+.+.+
phoPR phoP ++++++++....+++++++++.++++++++++++++++++++..++++++
prkA prkA *+*.............+++++.++..........+.+.............
safA-coxA safA No ortholog data.
spoIID spoIID **+.........................................++..++
yqhV-spoIIIAABCDEFGH spoIIIAA *++.........................................++....
yqhV-spoIIIAABCDEFGH spoIIIAG No ortholog data.
spoIIM spoIIM ***...+......++........+............++......++....
spoIIP-yqxA spoIIP No ortholog data.
spoIVA spoIVA No ortholog data.
spoIVCA spoIVCA *+*.++++....+++.*++++.++..+..+...+++++......++...+
spoIVCB-spoIIIC spoIVCB *+*...++.....++.+++++.++.....++++.......+++.++++..
spoIVFAB spoIVFA **++..++....++++++++++++++++++++++++++*+..+*++++*+
spoVB spoVB ***++*++....+...+++++.++*+++++...+++++.......+.+++
spoVD spoVD *+++++++....++++++++++++++*+++++++++++++++**++++++
murE-mraY-murD-spoVE-murG-murB-divIB-ylxWX-sbp spoVE +***+*++....++++++++++++++*+++++++++++++++*+++++++
spoVID-ysxE spoVID No ortholog data.
spoVK spoVK +*..........++++.......+.....+..+++.+.......++...+
spoVM spoVM No ortholog data.
spoVR spoVR +*+.............+++++.++..........+.+.............
usd-spoIIID-mbl-flhOP usd No ortholog data.
yaaH yaaH ***.......................+.......................
yabMNOPQ-divIC-yabR yabP No ortholog data.
ybaN ybaN ***+++++.....++++++++.++..+..+++.+++++..++..++.+++
ycgFG ycgF **..........+...+++++.+++++..+..++++++......+..+.+
ydcA ydcA ++++*+++....+++++++++.+++++..+..*+++++....+.++++.+
ydcC ydcC **+.............+++++.++++++++++++++++++..+*..+..+
ydhD ydhD ***.......................+.......................
yfhS yfhS No ortholog data.
yfnHGFED yfnE +++++++++++++++++++++.++++++++++++++++++...+++++++
yhaX yhaX +**+*+**++++++++++++*++.++.+++...++.+...+++*+*.+++
yhbH yhbH +++.............+++++.++..........+.+.............
yhcOP yhcO No ortholog data.
yheCD yheC No ortholog data.
yhjR yhjR +++..............................++++.........++..
yhxC yhxC ++++++++....++++++++++++++++++++++++++++++..++++++
yitCD yitC +.+..........................+..............++.+.+
yjbE yjbE +++...++....+++.++++++++++++++++++++++++....++...+
yjbX yjbX No ortholog data.
yjcA yjcA No ortholog data.
yjdH yjdH No ortholog data.
yjfA yjfA No ortholog data.
uxaC-yjmBCD-uxuA-yjmF-exuTR-uxaBA yjmC *.+.........+...***.+..+++.......++++.............
yknT yknT No ortholog data.
ykvI ykvI +++...+.....+.....................................
ykvUV ykvU ***++*++....+...+++++.++*+++++...+++++.......+.+++
ylbJ ylbJ *++...+.........+++.+.+...........+.............+.
gerR ylbO No ortholog data.
yloB yloB ++++++.++++++++++++++..+..........+++.......+++.+.
+++.........................................++.+..
yncD yncD ++++++++....+++++++++.++++++++++++++++++..+++++.++
yndA yndA No ortholog data.
yngJIHGFE yngJ +*+...*.....++*++++++.++...+++...+++++.......+..++
yoaW yoaW No ortholog data.
ypjB ypjB No ortholog data.
ypqA ypqA No ortholog data.
yqfCD yqfC No ortholog data.
yqfZY yqfZ No ortholog data.
yrrRS yrrR ++++++++....++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
ysnD ysnD No ortholog data.
yteV yteV No ortholog data.
ytrHI ytrH No ortholog data.
ytvI ytvI *++++++*....+++.++++*++++++++++++++++++*..++++++++
ytxC ytxC No ortholog data.
yunB yunB No ortholog data.
yuzC yuzC No ortholog data.
ctpB yvjB +++...++........+++++.++++++++++++++++++++++++++++
ywdL ywdL No ortholog data.
yxjC-scoAB-yxjF yxjC +++.+.+.....+...+++++.+++*.+++..................+.
yyaD yyaD +++...+.....+.....................................
yybHI yybI No ortholog data.




Copyright: Human Genome Center, Inst. Med. Sci., Univ. Tokyo; 1999-2005
Contact: Kenta Nakai