SigB alignment

aldY -------------ATTC---GTTTAC-----ATATTGGCTTCAG---CGGAAA---TAGAAGAAGACA------------------
bmrU ------------TCTTC---GTTTAC---TGCTTACAGAAAAAG---GGGATT---ATATAACC/A/GAA----------------
cdd -----------TTTTTA---GAAATG-GGCGTGAAAAAAAGCGC---GCGATT---ATGTAAAATATAA/A/GTGAT---------
clpP --------CATACGATG---GTTTGA---ACCCCTGTATTTTTG---GGGAAA---ATGGGAAAA/AG/AGACGACTTTGCATATC
csbA ------------ATGGT---GATTGA----TTTTGGCTGAAAAG---GGGTAT---GGTGTAAGT/A/GA----------------
csbB ---------AAAAAACA---GGTTTA---AACGACTTTAAAAAA---AGGAAT---AGCCTTAC/T/GA-----------------
csbC ---TTTTCAAAACAAAT---GTTTCA---AATGAGATAGGAAAT---GGGTAC---TAATCTATTAACTT----------------
csbD -----TAACATTAGAAT---GTTTAT-----TGCCTCTCAGATC---GGGAAG---TTAACAAGTACACACAT-------------
csbX ----------CTAACAG---GATTAC----AATTCAGCAAGCTT---GGGTAC---ATACTCCATT/G/ATAC-------------
ctc -------------CGAG---GTTTAA----ATCCTTATCGTTAT---GGGTAT---TGTTTGTAAT/A/G----------------
ctsR -----ATCAGCAATCAG---GTTTTG----TGGACCGGGAAAAT---GGAAAT---AATGAAGG/A/T/A/GAG------------
dps ------------AAGAG---GTTTTA----GCGTACGATATTAA---GGGTAT---ACATAGTCAT/A/TA---------------
gsiB ------------TGTTT---GTTTAA-----AAGAATTGTGAGC---GGGAAT---ACAACAAC/CAA/C----------------
gspA ---------------AC---GTGTTT----ATTTTTTTGAAAAA---GGGTAT---GTAACTTGT/A/C-----------------
gtaB ------------AAAAT---GTGTAA----AAACATATTGAAAA---GGGTAA---ATAGAGAAT/A/GT----------------
katE ------------TAGCA---GTTTAT----ATGAAGAACGCCAC---GGGTAA---ATGTGCTGT/A/GAA---------------
katX -----AAAAAAACGGCT---GTTTTA---AAATCTTTCCATTCA---GGGAAT---ATTGTTAC/C/GTTCAA-------------
nadE ---------ACAGTCAT---GATTCA----TTTTCATTGATTTA---GGGAAA---TGATCAGT/A/ATAAGGGA-----------
opuE -------------CAAT---GTTTCA----TCGCTTGAATGGCC---GGGAAT---ACTTTGTT/A/GGTTAA-------------
phoP ---------GTTAAGAT---GACATA-----AAATAGAGAAATA---GGATGT---CGGGG/A/ATTATAA---------------
relA -------------TTTG---CATTTA---TTTTATATAATATTT---GGCTAT---TTGAACTTC/T/GCT---------------
rsbV ------------GAAAG---GTTTAA----CGTCTGTCAGACGA---GGGTAT---AAAGCAACT/A/GT----------------
trxA -------------TCAG---GTTTTA----AAACAGCTCCGGCA---GGGCAT---GGTAAAGTAC/A/T----------------
yacL -------------TTTC---GGTTAA----AACCTTATGAATAC---GGGTAT---ATTAATGTT/G/GT----------------
gabD --------------AAC---GGATTA----CTTTTGCTGACAGC---GGGAAT---TAACGGTA/A/TAT----------------
ydaD -----------AGCCAT---GTTTAT----CCAAAGAGTGTGTG---AGGTAC---ACAACAAA/TA/GAC---------------
ydaG ---------------TT---GTTTAA----ATCTTCCCCGGATG---TGGAAA---AGTAACAG/C/GGA----------------
ydaP --------TCCGGGTTT---TAAAGC---CTTTCTCCTGTGGTA---TTGAAA---AAA/GG/AA---------------------
ydaS -------------AAGT---GTTTCG-----AAATGATCAGGAG---CGGTTA---TTGATTGGTAAAT-----------------
ydaT -------------ATGC---GTTTTT-----ATTTTTCACCTGC---GGGTAC---CATTTTTATAAA------------------
ydbD ----------GTTTTTC---GTTTAT------CTTTCTATCGAT---CGGAAA---TATAAAAAGA/G/ATAA-------------
ydbP ----------CTTTGAT---TACAGC----CAGAGCTGTCTGCA---GGGAAA---CATTATGTTCTG------------------
ydfO ---------AAGACACC---GTTTCG----TTTTATGAAAACAG---GGGAGA---ACAATTTAAGA/G/AGAT------------
ydhK -------------TTAT---GTTTGG----CTTTGCAAACAAAG---GGGAAT---AGGACAAACTGC------------------
yfhK -------------ACAT---GTTTCA---CCAGCCTGTCAATCA---GGGAAT---ACCACTTATATC------------------
yfkJ --------TTCATGAAG---GTTTCT----TTTTAGAGAAATAG---GGGCAA---AGAATAGGG/A/GGTTGCAC----------
yflA -------------AAAG---GTTTAT----GTTTTTCCATCTAT---GGGAAA---TGATTCA/T/AAAC----------------
yhdF -------------TGGC---GTTTAT----TCATTTCTGTCGTG---TGGTAA---CGTTCAGT/A/TCA----------------
yhdN --------------AAG---GTTTAA----CATTTTTTCCAGAG---GGGAAA---AGATAGTGAAA-------------------
yjbC ----------TAAGGCT---GTTTAA-----ACAAGAAGAAATG---GGGTAT---ATCTAAAAGT/A/TGAAG------------
yjgB -------------ACAT---GTTTCG-----TTGCAAAAACACG---GGGAAA---CGGAATGGTAGA------------------
ykgA -------------AATG---GTTTAA---TGATTTTCATGATGA---GGGAAT---AATAAATGTATT------------------
ykzA CTCGGCAAACATAGCAT---GTTTAA------AAAGATCAGAAA---GGGAAA---TATAACAACT/A/GATA-------------
yocK -----CGATGTTTCCAT---GTTTGA-----CAGAAGGCAAAAC---GGGAAA---CAGGATAGAAAGG-----------------
yotK -------------TCTA---GTTTCT---CTTTTTAAAAGAGTA---GGGTAT---TGCAAACAACAG------------------
yoxA -------------AACG---GTGTTT-----TTTTATTTGATAG---GGGAAA---ATATAAAATGGA------------------
yoxC -------------TTCT---GATTAA-----AAAAACGGATACA---GGGTAA---TGACATAAGAAA------------------
ypuB -------------TGCT---GATTAT----ACAAAAAGTGGATT---GGGAAT---GATAAAAGAACA------------------
yqgZ ---------CTGTAAAT---GGTTTA---AATGAAAAATGATCC---GGGTAG---TTATTCTACAAA/G/AGATGGTT-------
yqhA -------------TTCG---GTTTTT--CACCTGTCCAGAAACT---GGGCTA---GCTGGATTCGAAC-----------------
yqhQ -------------CTGC---GAGTAA----AATTTGAAAATAAC---GGGTAT---AATGCATGTAGG------------------
yqxD -----------ATCCTG---GGTTTT----TGGCTGTGCCAAAA---GGGAAT---AATGAAAAA/CA/ATAGCA-----------
yqxL -------------ACTG---GTTTAG-----TGACGCGGTTATT---GGGCAA---TTAAAGAATAAA------------------
yrvD -------------CCAT---GTTTAA----AACCAGTCTTGATT---GGGAAA---GTTACCTCAATA------------------
ytkL -------------ATAA---GTTTTT----CAGCTTTTTAAAAA---GGGAAA---ATAAAAAAAACA------------------
ytxG --------AGTACACAT---GTTTAT-----GATTGAAGAAAAC---GGGTAA---ACAGCAG/T/ATAT----------------
yvrE --------------AGT---GGTTTG----GACACCTCTTTGCC---GGGAAT---AACAATATATAG------------------
yvyD ----------GATTTAT---GTTTCA----GCAGGAATTGTAAA---GGGTAA---AAGAGAAAT/A/GATACA------------
ywjC ---------AAAAATAG---GTTTAC----GACTTGTCAGCTTT---GGGAAC---TTAGGCTATA/T/AAGACAA----------
ywmE --------TTTTTTATT---GGTTTA----AAAACAGTTTGGGC---GGGAAT---GATACCCTAAAAA/G/GGGTT---------
ywtG ----------TAAAAAG---GTTTAA----TGGCCGGAAAAAGA---GGCTAA---AAGATTTCTAAAAAAA/T/CCC--------
yxkO -------------TTTT---GTTTGA----AAAAGAAAAGGGAC---AGGAAA---AATAGGAAAAGA------------------
yycD -------------GATC---GTTTCG----GACAGTAACAAGGC---GGGAAA---AATGCAATAAAA------------------
Link to : Weight matrix