SigK alignment

cgeA ----TTCGACTCA---TACC---AAATAACAGCCGGAAG---AATATGAAT---AACGT/G/AGTT-----------------
cgeC ----CATAGCCTA---TACC---ATAAATCGAAGTCGCA---CATATTGTG---AAACA/G/AGAT-----------------
cotA ----ATTTTTTGT---AACC---ATCACGTCCTTATTGT---CATTAACTA---TAGT/A/CCAAT-----------------
cotB ----TTGAATTAG---TTCA---ACAAATAAATGTGACA---CGTATATAT---GCAGT/A/TGT------------------
cotC ----AACTGTCCA---AGCC----GCAAAATCTACTCGC---CGTATAATA---AAGC/G/TAGTA-----------------
cotD ----TTGCATCAG---AACA---TGTACCCCTTATTTTT---CATAACTTA---GTATT/G/TAAT-----------------
cotE ----ATAAAAATG---CACA---CTAGACAAATGCCCAG---CATAAGATA---ACACG/A/AGAA-----------------
cotF ----AACATCATG---AACA----ACATTGAGCGTTGGG---CATATGCTG---ATATGG/A/A-------------------
cotG ----GAACACTTA---TACA----CTTTTTAAAACCGCG---CGTACTATG---AGGGT/A/GT-------------------
cotH ----CAATTTGAA---ATCC----TCCTTTTAAAAATAT---GTTAAGGAT---GAAGATC/CT/TACTACCCTCATAG----
cotM ----TTATGCGTT---CACC---CATTTATACTCCACCG---CATATGATG---TAAA/G/CA--------------------
ydgB --------CAAGG---AACA---ATTGGGTGCAGCGGCG---CATAATGTA---CTGTACAGAAAGATGGAA-----------
cotSA ----CCCATTCCG---CACA----AGTTGGTTGTTCAGC---CGTATCATG---ATTCT/A/AC-------------------
cotT ATGAATGTACATA---CACC---CAACTTAAGCATCAGG---AATATGGTA---AAAG/G/AATAAAAAA-------------
cotV ----TTTTATTAT---TCCG---CTCTGCACCCCATTTG---CATTATATA---GAGT/A/TGGAT-----------------
cotX ----TATGACTCA---GTCA---AAATAAGAGGCTCGCT---CATTTAATA---ACAGT/A/AAAG-----------------
cotY ----GTTCACCCA---CACC---AAGTGGGGCACGGGTA---CATATGTTG---TTAAGG/A/CTA-----------------
cwlC ----AATCGTACA---AGCA----GAAGCCGTGTTTTTT---CATATCCTG---TAAT/GA/GGTG-----------------
cwlH ------AAAGGCT---GTCC---ATCTCTCTGTTTTCTG---CATTCTTAT---TAAT/A/GGGAGGGATAGAA---------
ftsY ------ACTCCAA---TACT---TACGGGAGGAATACAG---CTTGTCCTT---TGAGGGGGCAAAAG/A/GAAA--------
gerE ----TGTAAACGT---CACC---TCCTGCGCCCTTCTTA---CATATGATA---TCTC/G/ACTAT-----------------
gerPA --------TTTCT---CTCA---CGCATATGTGCGTTTG---TCATAAGCT---ATCGT------------------------
spoIVCB ----CGGTACAGA---CACA---GACAGCCTCCCGGTCA---CATACATTT---A/CATA/TAGGC-----------------
spoVFA ----TTTTATATT---CACC---GGTATTTCCTTTTGAT---CATAAGATG---AA/GGG/GAGCTTAA--------------
spoVK ----GGCGTTTGT---CACA----ATCGGCATCCGCTTG---AATATCATA---TAGAG/A/GAAC-----------------
spsA --------CCTAG---CGCA---ACTTGAGCATAAGCAA---CATAAGATA---ACGAT/AG/TTT-----------------
sspG -------CGTCCA---ATCT---CTTTACTCTCCTATCG---AATATCCTG---TCACT/A/TC-------------------
tgl --------TAACT---TTCA---TTGCCCAAGCTCTTTG---CATATCTTA---T/AAAAAA/CAAGGGGGGCTAAACATG--
yabG ----TGTTTTGCG---CACC---ACATGGACTGCCGCTA---CATAGGCTA---GAGA/AG/GA-------------------
yfhP ---------GTTG---TACA----CTAAGGGCACAGTAC---GATAATATG---TTACAT-----------------------
yfhP ---------AGGG---CACA---GTACGATAATATGTTA---CATTAAATA---GTAATA-----------------------
yfnE --------GTGAA---AGCA---AGCGTTATTATTCCTG---CATATAATT---CGA/AG/GAGC------------------
yfnH --------TTGGT---CACC---AAGGCTGGCTTTCTCT---CATATCATT---ACAGT/AG/ATTT----------------
yhcO --------AATGA---CACA---CTGCGAACTCAGGCTG---CATAGAGTA---AAAAT/AAAAAG/GTACA-----------
yhjR --------CTCCG---CACA----TCTCTCCCTGCCCAA---CATATACTT---TTAC/AG/AAGCCCAATTCCTAAG-----
yitB --------ACCTG---AACC----TTTATGCAAAAAATG---AATAGTCTG---CCTAT/AAC/TCGA---------------
yitC --------TGCGG---AACC---ATTAAGAGCCCGGCTG---AATATGCTT---TTTAGC/AAAAT/GGTTTTAT--------
yjcB TTTTTGTTTTTTT---AACG---AGGCGGTCTCGCTCAG---CATATATCA---TAA/GC/GGGGGGATAA------------
yjcZ --TGCGAATATCC---AAGC---CGATCCCAGCAGCTCA---CATAGTGTA---TAG/A/GAGTAAAGGA-------------
yjcC -ATGTTGGAAAAG---CACA---TTGTATTATGTGCATT---CATACAATA---CCGT/A/TTACTCCGCC------------
ykuD --------AATGT---AGCA---GGATGGGCTCCTCATC---AATACTTAT---AAGT/AAA/AAAGGAGGATGAGGAAACTG
ylbD --------AGGCG---AACA---CAATGCCCGACAAAAC---GATACATTG---TAGT/AG/GTAACGATTTT----------
yndL --AAAATGAGAAG---AACA---GCGCCCGGGCTAATGG---TATATAATA---TTG/T/GAATTTAA---------------
yngK --------TTAAT---CACC----CTTTTATAGCCCGGG---AATACCGTA---ATAGC/G/AATA-----------------
yoaN ---------TAGG---CACA---GCAATCTAAGATTCTG---CATAGGCTG---AAAT/AAAAT/CTTGTTCATT--------
yobW -----ATTTCAGC---TACT--ATTTCCGACCGGATAAG---CATACACTT---CTCAA/C/GGAGGGGA-------------
yodH --------TCATA---AACC----TATGTCTTTATACGA---CATATGATA---AGG/AA/AAAGGAGGATTCGATATTG---
ypqA --------TTTAT---AACA---ACATCTGGCATAGACG---CATAATCTG---GTT/AAA/AAAGGCGGT------------
yrkC --------TTTAG---CACA----CTCCCTTAATAAATG---CATAGGATA---CTATC/AC/AAAAATTTATA---------
ysnD --------ATAGG---CACT---TCTCTTGTTCCCTCGG---CATACATTA---ATG/ATAT/CTTGC---------------
ytlA --------GCATT---CACA----CATTTTTATACCCAT---CATACGATA---TGT/AAAG/CAAA----------------
yxeE --------ATGCG---TGCC---ACTGTGCCAATGACTA---CATAAGTTA---T/AAG/GAATTCACCC-------------
Link to : Weight matrix