Phylogenetic profile
:
CodY
Orthologous information of transcription factor. (
Explanation
of these marks.)
TF
COG
Orthologs
CodY
COG4465
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
Orthologous information of regulated genes. (
Explanation
of these marks.)
Regulated operon
Regulated gene
Orthologs
acsA
acsA
*
+
.
*
.
.
+
*
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
*
+
.
+
*
.
*
+
.
.
+
*
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
*
.
.
+
citB
citB
*
.
+
+
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
*
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
*
+
.
.
.
.
.
.
+
.
.
*
comK
comK
*
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
dppABCDE
dppA
*
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
gabP
gabP
*
+
*
+
+
.
*
*
.
.
.
.
+
+
+
+
*
*
*
*
*
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
*
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
hag
hag
*
+
*
.
.
.
.
*
.
.
.
.
.
.
.
.
*
*
*
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
+
*
+
+
+
+
*
+
*
.
.
.
.
+
+
.
.
*
+
.
.
hut
hutP
No ortholog data.
ilvA-ypmP
ilvA
*
+
.
+
.
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
*
*
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
*
+
+
+
.
.
.
.
+
*
.
*
*
+
ilvBHC-leuABCD
ilvB
*
*
*
+
.
*
*
+
.
.
.
.
+
+
+
+
*
*
*
*
+
+
+
+
*
*
+
+
+
*
.
.
+
+
+
+
*
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
+
ilvD
ilvD
*
+
+
+
.
*
*
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
*
*
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
+
ptb-bcd-buk-lpdV-bkdAABB
ptb
No ortholog data.
rapC-phrC
rapC
*
*
*
*
+
+
+
*
.
.
.
.
.
.
.
.
*
+
+
+
+
.
+
+
.
*
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
*
+
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
*
+
srfAA-srfAB-comS-srfAC-srfAD
srfAA
*
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
*
+
+
+
+
+
+
.
+
*
.
.
.
.
.
+
.
.
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
*
.
.
.
.
ureABC
ureA
+
*
.
.
.
.
*
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
+
+
+
.
.
.
+
*
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
+
ybgE
ybgE
*
+
+
*
*
+
+
*
.
.
.
.
+
+
+
+
*
*
*
+
*
.
+
+
+
*
*
+
*
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
yhdG
yhdG
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
.
.
+
.
Copyright: Human Genome Center, Inst. Med. Sci., Univ. Tokyo; 1999-2008
Contact:
Kenta Nakai