Phylogenetic profile
:
DegU
Orthologous information of transcription factor. (
Explanation
of these marks.)
TF
COG
Orthologs
DegU
COG2197
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
+
Orthologous information of regulated genes. (
Explanation
of these marks.)
Regulated operon
Regulated gene
Orthologs
amyE
amyE
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
.
+
aprE
aprE
*
*
*
.
*
*
.
.
*
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
.
+
+
.
.
+
*
*
*
.
.
+
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
*
+
.
*
+
licT-bglS
bglS
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
bpr
bpr
+
+
+
.
+
+
.
.
+
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
.
+
+
.
.
+
+
+
+
.
.
+
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
comK
comK
*
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
degQ
degQ
No ortholog data.
degSU
degU
+
*
*
+
+
+
*
*
.
.
.
.
+
+
+
.
*
*
*
*
+
.
+
+
*
+
*
*
*
+
.
.
.
+
+
*
+
+
.
.
.
.
.
.
*
*
.
.
.
+
fla-che
flgB
+
+
+
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
.
.
+
+
.
.
ispA
ispA
+
+
+
.
+
+
.
.
+
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
.
+
+
.
.
+
+
+
+
.
.
+
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
nprE
nprE
+
.
+
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
sacB-yveBA
sacB
No ortholog data.
sacXY
sacX
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
*
.
+
.
.
.
*
*
*
*
+
+
+
+
.
*
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
*
.
.
.
.
*
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
*
*
+
.
.
.
*
*
*
*
+
+
+
+
.
*
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
*
.
.
.
.
*
.
sipS
sipS
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
sipT
sipT
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
wapA-yxxG
wapA
*
.
*
.
.
.
.
*
.
.
.
.
.
.
.
.
*
*
*
*
+
.
.
+
.
.
.
.
.
*
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
ycdA
ycdA
No ortholog data.
yukEDCB-yueB
yukE
+
+
+
.
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
ywsC-ywtABC
ywsC
No ortholog data.
yxjJI
yxjJ
No ortholog data.
Copyright: Human Genome Center, Inst. Med. Sci., Univ. Tokyo; 1999-2008
Contact:
Kenta Nakai