Phylogenetic profile
:
SigA
Orthologous information of transcription factor. (
Explanation
of these marks.)
TF
COG
Orthologs
SigA
COG0568
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Orthologous information of regulated genes. (
Explanation
of these marks.)
Regulated operon
Regulated gene
Orthologs
abnA
abnA
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ackA
ackA
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acsA
acsA
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acuABC
acuA
No ortholog data.
adaAB
adaA
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addBA
addB
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adhA
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ald
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alkA
alkA
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alsS
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amhX
amhX
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amyE
amyE
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ansA
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antE
antE
No ortholog data.
aprE
aprE
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aprX
aprX
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araABDLMNPQ-abfA
araA
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araE
araE
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araR
araR
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arfM
arfM
No ortholog data.
argCJBD-carAB-argF
argC
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arsR-yqcK-arsBC
arsR
No ortholog data.
spoVFAB-asd-dapG-dapA
asd
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bceAB
bceA
No ortholog data.
bglC
bglC
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bglPH-yxiE
bglP
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licT-bglS
bglS
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blt
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bmrU-bmr-bmrR
bmr
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bpr
bpr
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bsrB
bsrB
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ccdA-yneIJ
ccdA
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ykuJK-ykzF-ykuL-ccpC
ccpC
No ortholog data.
cdd-era
cdd
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cggR-gapA-pgk-tpiA-pgm-eno
cggR
No ortholog data.
citA
citA
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citB
citB
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citG
citG
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citM-yflN
citM
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citR
citR
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citZ-icd-mdh
citZ
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clpE
clpE
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clpP
clpP
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clpX
clpX
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codV-clpQY-codY
codV
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No ortholog data.
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guaD
guaD
No ortholog data.
gudB
gudB
No ortholog data.
gutBP
gutB
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hpr
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lepA-hemN-hrcA-grpE-dnaKJ-yqeTUV
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hutP
No ortholog data.
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icd
No ortholog data.
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ilvB
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kdgRKAT
kdgR
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kinB-kapB
kinB
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kinC
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ldh
No ortholog data.
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lepA
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liaGFSR
liaG
No ortholog data.
licBCAH
licB
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licR
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lonA-ysxC
lonA
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lrpC
lrpC
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lysC
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lytABC
lytA
No ortholog data.
lytE
lytE
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lytR
lytR
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maeN
maeN
No ortholog data.
malA-yfiA-malP
malA
No ortholog data.
mecA
mecA
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med-comZ
med
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mhqA
mhqA
No ortholog data.
mmsA-iolBCDEF-idh-iolHI-fbaB
mmsA
No ortholog data.
mrgA
mrgA
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mta
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mtrAB
mtrA
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narK-fnr
narK
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nasA
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No ortholog data.
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No ortholog data.
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No ortholog data.
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No ortholog data.
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No ortholog data.
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rpoB
rpoB
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ywjF-acdA-rpoE
rpoE
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rpsD
rpsD
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rrnA-16S-trnA-Ile-trnA-Ala-rrnA-23S-rrnA-5S
rrnA-16S
No ortholog data.
trnB
rrnB-16S
No ortholog data.
rrnD
rrnD-16S
No ortholog data.
rrnO-16S-trnO-Ile-trnO-Ala-rrnO-23S-rrnO-5S
rrnO-16S
No ortholog data.
rsbRSTUVW-sigB-rsbX
rsbR
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sacB-yveBA
sacB
No ortholog data.
sacPA-ywdA
sacP
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sacXY
sacX
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sboAX-albABCDEFG
sboA
No ortholog data.
yaaJ-scr
scr
No ortholog data.
sda
sda
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sdhCAB
sdhC
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secA-prfB
secA
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fla-che
sigD
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sigH
sigH
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sigM-yhdLK
sigM
No ortholog data.
sigX-rsiX
sigX
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sinIR
sinI
No ortholog data.
sinIR
sinR
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sipS
sipS
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gapB-speD
speD
No ortholog data.
speE-speB
speE
No ortholog data.
spo0A
spo0A
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spo0B-obg
spo0B
No ortholog data.
spo0E
spo0E
No ortholog data.
spo0F
spo0F
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spoIIE
spoIIE
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spoIIGA-sigE-sigG
spoIIGA
No ortholog data.
spoIIIE
spoIIIE
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spoIIIJ-jag
spoIIIJ
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+
srfAA-srfAB-comS-srfAC-srfAD
srfAA
*
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ssuBACD-ygaN
ssuB
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tagAB
tagA
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tagDEF
tagD
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tetLB
tetL
No ortholog data.
thrS
thrS
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thrZ-ywhA
thrZ
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thyB-dfrA-ypkP
thyB
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trePAR
treP
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rrnD
trnD-Asn
No ortholog data.
rrnD
trnD-Leu2
No ortholog data.
trpEDCFBA-hisC-tyrA-aroE
trpE
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trxA
trxA
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tuaABCDEFGH
tuaA
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tyrS
tyrS
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ureABC
ureA
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uxaC-yjmBCD-uxuA-yjmF-exuTR-uxaBA
uxaC
No ortholog data.
valS-folC
valS
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veg
veg
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wapA-yxxG
wapA
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xpt-pbuX
xpt
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xsa
xsa
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xylAB
xylA
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xynA
xynA
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xynPB
xynP
No ortholog data.
yaaA-recF-yaaB-gyrB
yaaA
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yaaA-recF-yaaB-gyrB
yaaB
No ortholog data.
yaaJ-scr
yaaJ
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skf
ybcO
No ortholog data.
ybgJ-ybgH
ybgJ
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yccC
yccC
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ycdA
ycdA
No ortholog data.
ycdHI-yceA
ycdH
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No ortholog data.
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ydjM
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No ortholog data.
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yetM
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yfiDE
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yflG
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yfmP
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No ortholog data.
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yhcL
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ykcBC
ykcB
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ykoL
No ortholog data.
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ykrW
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ylxM-ffh
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ccdA-yneIJ
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mhqED
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yoeB
yoeB
No ortholog data.
ypuE-ribDEAHT
ypuE
No ortholog data.
txpA
yqdB
No ortholog data.
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yqxD
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yqxM-sipW-tasA
yqxM
No ortholog data.
yraB
yraB
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yraC
yraC
No ortholog data.
yrkO
yrkO
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yrkPQR
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yrrT-mtn-yrhABC
yrrT
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No ortholog data.
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No ortholog data.
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ywsC
No ortholog data.
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yxeKLMNOPQ
yxeK
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yydFGHIJ
yydF
No ortholog data.
Copyright: Human Genome Center, Inst. Med. Sci., Univ. Tokyo; 1999-2008
Contact:
Kenta Nakai
