Similar regions between promoters of blt
<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub TAAATAGACTGATGACTTGAAAAGTCTCAAATTGATGATAGGAATAATATCTATACCCAT hal ............TGTCTAGAAATATTTCATACTGTAGGGAGGAAGAGT.....TAACCAT -300 -290 -280 -270 -260 -250 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub TTTCTTTTTTTATTTCCGGCGAGAAAAGACCAATCTCATCATAATGAAATAAAGTTTGTT hal TTTTTCTTCCCTTTTCCTG.GACAAAAGAGGAGTATCA........AAACATACTTGGTT -240 -230 -220 -210 -200 -190 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub TTTTTACACGGCAGAGCTTCGAAAACTCCCCTGTTGTGAAATACTTCTTAACATCTTCGC hal ACTTTAC--GTTTGTGCAACGTAAAGTAACCA-TTTTTTCTTCCCTTTTCCTGTCTTCCA -180 -170 -160 -150 -140 -130 @@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@ <<<< sub TCATAAAAACCTCCTTGACTATACGGTAACCATATACCTTATGATTTGATTGTACTTGAA hal TCAT........................................................ -120 -110 -100 -90 -80 -70 sub AAAAGCTTCAAGCGAAAAGGATAGGTAAAAAGGGTTCAATTGAGTAAAAGGGGAATTCAG hal .....................TAGGTTAAAATGATTGA...................... -60 -50 -40 -30 -20 -10 -1 > : other CDS - : gaps within a similar region ] : terminator . : gaps between similar regions } : RNAs @ : known binding sites <,[,{ : opposite direction About alignment...