Similar regions between promoters of fhuB
<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub TAGCCGTCTGCCATGACAACCACCCGTTTAGGATGCTTCGGGATTTTTACATTTCCGTTT hal ................................ATGCTTAGGGCGTTTTCAAATTCAGTCC -300 -290 -280 -270 -260 -250 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub TCAGCCTTGTATGTAAAGGTTTCTGCGCCTTTTGAATCAGAGGCAGAACCTTTGCTTTCT hal TCCTTCTGTTTTTTCATTGAATCT.....................GAATCTTTCTTCTTT -240 -230 -220 -210 -200 -190 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub GAGTTATTCCCGCAGGCTGCCAGCGCTGCAATCAATAACAGGGCAAAAAACGCGGCTCCG hal CCGTTAT..................................................... -180 -170 -160 -150 -140 -130 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub AGTTTCTTGTATATATGGGTCATATCTCATACCTTCTTTCTAAAAGATAGATGAAAAAGA hal ...............................................TGGTTGAAAAAGA -120 -110 -100 -90 -80 -70 sub GAATCATTATCATCTGTGATTATACCACTGCAAGTGCCGGTTGACACGATATTTTTGCAA hal GCATTACGAACATCGCTCATT....................................... -60 -50 -40 -30 -20 -10 -1 > : other CDS - : gaps within a similar region ] : terminator . : gaps between similar regions } : RNAs @ : known binding sites <,[,{ : opposite direction About alignment...