Similar regions between promoters of kbaA
<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub AGCGCTTCATTCATGGCATCATCATTTAATAATTCCTTAATAGCTTTCTTTCCATCATCA hal .....TTCACTCATTTTGTCATTAATT............ATGGCTTGTTTTCCTTCTTCA -300 -290 -280 -270 -260 -250 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< <<<<<< sub GTTTTTAATATATCAACAACCATTTTTTTGGTCTGATCATAGTCCATA------TCCGCT hal GTCTGCAACATGTCGACCATCATTTTCTTTGTACTTTCGTAATCAGGAGGTTGATTCCCT -240 -230 -220 -210 -200 -190 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub GCTTGGTCTTTTGGAGCGCAAGCTGTTACAGATA-ATAACAAAAAACAGCTCATCAATAG hal CCCTGTGCTTGAGGTGCACA-GCCGATGATGATGGACAATAACGCAATGCAAATGAGCAG -180 -170 -160 -150 -140 -130 <<<<<<<<<<<<<<<<<< sub CGTTTTGGCTTTTGACATG-CTTAAGCTCCTTTCACATACTTGTCTTACCTTTAATATGA hal CGCC---CCTTTTCTCATCACTTCTGCTCCTTTCACTCATTT----TGTCATTAATTTGA -120 -110 -100 -90 -80 -70 sub TTCATCTGTTTGGAATT-ATACATAACAAAATATCGCTGTTCGCGATTTTTGAGGGGATG hal GACATTTTCTTGAACTTTATGCAT.................................... -60 -50 -40 -30 -20 -10 sub AATAAAGAA hal ......... -1 > : other CDS - : gaps within a similar region ] : terminator . : gaps between similar regions } : RNAs @ : known binding sites <,[,{ : opposite direction About alignment...