Similar regions between promoters of lexA
<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub TTGACCAGAGTGTGTCGCCTTGCTGGACTTCTATTTTAACATACTGATTAAGCTCTTGGC hal ..................CGTTCCGTACATCAATAATAACGTAATAAGT...CTCTTGTT -300 -290 -280 -270 -260 -250 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< <<<<<<<<<<<<< sub CGCTGCTTGTATATGACAGCATAAGGATAACCGCGCTCAAAATCAC-TGTAAACAGACCG hal CG-TACGAGAACATAGAGGTAGAAGCAGGATCGCTATCATCAGCAAATATAAGCGTTCCG -240 -230 -220 -210 -200 -190 @@@@@@@@@@@@@@ <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub -ACAAAAATAATAGATTCTTTACTCATGATCATAACCTCCAACAGGAATGTTTGTTCGCA hal TACATCAATAATA..............GAGAATCACCTC--ATAAGAATGTTTGTTCCCC -180 -170 -160 -150 -140 -130 @@@@@@@@@@@@@@ @@@@@@@@@@ sub TTTTTATAATTTCAGTATATACGAACAAACGTTTCTGTCAATTGTTTTTTCGAACCTATG hal TTT--ATCAT------AAACAAGAACACTTGTTTGTGTCAACAATAAATTAGAACTTATG -120 -110 -100 -90 -80 -70 @@@@ sub TTTGTACTGTAAGGAAAATCATGCTATAATCTTCTTAAAATCGACGTTTTGAGGTGCGAA hal TTTGCATTACATATGTTCGCATGGTATAATTTAGTCAGTATAG................. -60 -50 -40 -30 -20 -10 sub AA hal .. -1 > : other CDS - : gaps within a similar region ] : terminator . : gaps between similar regions } : RNAs @ : known binding sites <,[,{ : opposite direction About alignment...