Similar regions between promoters of sigL
<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub GGTTTATTTTGATTCTCCACGTTTGACTTTGTTGTATGCTTCATCTAAATGCTGAATCCG hal ............................................................ -300 -290 -280 -270 -260 -250 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< <<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub TTTCAGGACAACTGCGTTTTTCGTCAGCTGGTCCTGCACT-AGTGTTGAGACGACGGAAC hal .TTCAGGACAAGT...TTTATCGTAAGCGCTTACAGTCGTGAGCGGTTAGACG....... -240 -230 -220 -210 -200 -190 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub GGTAGTAGCTGTTCATCGCGTGGATTTTATCCTCAGACTGATTCATTTCAATATGCTGTT hal .......................ATTTTATCGTAAG........................ -180 -170 -160 -150 -140 -130 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub TTAAATTCTCAATAAAATAAGGGACGGAAAAAAGTTCAGACATTTCTTTGGCAGCTCCTT hal .........................................AATTCATATTCACCTTCCT -120 -110 -100 -90 -80 -70 sub TTTCATAAATGTATACGGTGTGATCTCAATC---ATGTACAATGAAGAAAGGGGAGTGAG hal TCGGATAAAT..ATAGTGCATGATCTCGATCCTCATGTATAAT................. -60 -50 -40 -30 -20 -10 sub CAAG hal .... -1 > : other CDS - : gaps within a similar region ] : terminator . : gaps between similar regions } : RNAs @ : known binding sites <,[,{ : opposite direction About alignment...