Similar regions between promoters of ydfF
<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub CTTTGTGTCTTTCCAAATTGTCGATGGCTTTTCCTCCCAGTCCTACTCCAAGGATTATAT hal .....TGCCGTTCTAAGTTTTCCATTGCTTTTCCGCCAACCCCAATCCCTAAAACAATAT -300 -290 -280 -270 -260 -250 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub AATGTCCAAGAGCCCAAGAAGAAGACATAGGACTAATATTAGTGGTTCCATCCTCATTCA hal GATTTCCTAAGACAAAAGACGAAGAAATGGGACTAATATTGACCGTTCCATCTTCATTCA -240 -230 -220 -210 -200 -190 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub ATGTGGTTAGAAGAAATGTCGAG-GTACCATAATACATGATCTTGGGTTTGATTTCCTTA hal GCGTCGTAAGTA-AGATGACGGGTGTTCCGTAATATAAAATGCTCGGTTTTA--TCGTT- -180 -170 -160 -150 -140 -130 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub AATCGACGAGTGTCTTGTTTTTTGATGTCCAACGTTTTTTCCTCCTTGTCACGCTTACAT hal -GTCGACT--TCACATGGCTCATTCGAGACATCCTTT----CTCCATTTGATGTC----- -120 -110 -100 -90 -80 -70 sub TTATATTGTAAAGGATTAACATTTCAACTATCATCGAAATATG-AATGTAAGGAGGAAAA hal TCTTATTGTAATTGATTGATATTTCAACTATCATCGAAGTATGGAATACAAGGAGG.... -60 -50 -40 -30 -20 -10 sub TC hal .. -1 > : other CDS - : gaps within a similar region ] : terminator . : gaps between similar regions } : RNAs @ : known binding sites <,[,{ : opposite direction About alignment...