Similar regions between promoters of yjbL
<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub TTTCTGCGGATACGAAGCGCAGCATGTTTTTGTTTCAGCGCGAAGCTGTCTGTATCAAAA hal ................................TTTTAACTGGAAGTCGTCCGTTTCAAAA -300 -290 -280 -270 -260 -250 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< <<<<<<<<<<<<< sub TAATGATTCTTTTGATCTGTAAAATCTTTTTCTGTCAGCTGGAGT--GCCGATGCTATGT hal TAATGATTGCGCTGAAGCTTAAAATCACCTTCTCCAATATGTAGTTGGCTAATGAGACGT -240 -230 -220 -210 -200 -190 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< < sub TTTTGAATTCTTGTTTGGTCAGCATGTTTTTAAATTCGATTTCAATCTCTTGGCTCA-TG hal T--TGAACGTTTCCTTCGATACGAGTGTTTTCCGTTCGATTTCAATTTCTTTTCCCAATG -180 -170 -160 -150 -140 -130 sub ATGCTCTTCCTTTCCGCCCTGTAAATCTTATTTTTACTATTATCTCTTTAGATGTTAGGT hal ATGATCGTCCTTTC.....................................ACGTGAGAT -120 -110 -100 -90 -80 -70 sub TTATCAATATCGAGCTCGATATGATAAAATGAATCTGTACTTTGTTTAAAAAAGGAGAGC hal TTTTCAAT..........ATATGATAAACTGAAT.......................... -60 -50 -40 -30 -20 -10 sub ATT hal ... -1 > : other CDS - : gaps within a similar region ] : terminator . : gaps between similar regions } : RNAs @ : known binding sites <,[,{ : opposite direction About alignment...