Similar regions between promoters of ykoP
<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub TAAATGCCGCTGTACGTTTTCGGGAAATATTGAATCCATTTTAAATAAGCCACGGAGGAC ste ..................................TCCATTTATAAT.............. -300 -290 -280 -270 -260 -250 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub AATTTTTCTAACCGCCTATACGAATGTGAAAAGATATCAATCTTTTCAGCTGCCAGCCCT ste .........AACCGCCTGGCCGTGTGCCAACAG........................... -240 -230 -220 -210 -200 -190 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub TGAGACTCTAATTCAGCCTGCAATGCATCAGCCACATGATGATGGCCGGTGGAAATGCTT ste ............................................................ -180 -170 -160 -150 -140 -130 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub AAAAAAGGAAAAATGAGAATGTTTTTCATGACAGTCCTCCTAAAAAAATATGGCAACTAT ste ...........AATGAGAA......................................... -120 -110 -100 -90 -80 -70 sub ATTTTGAGGAGAACGTTCACAAAATATAAGGGTGTTTTTG--ATCATAAGGAAGGTGAAA ste .....................AAACACAGCGGCGTTTGTCCAATCATAAG.......... -60 -50 -40 -30 -20 -10 sub AG ste .. -1 > : other CDS - : gaps within a similar region ] : terminator . : gaps between similar regions } : RNAs @ : known binding sites <,[,{ : opposite direction About alignment...