Similar regions between promoters of ykrU
<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub AAAGACGAATATTTATGATTCTCAG-GATCAGCGACAGCTCGTTTCATCTCCTCAACAAT hal ............TTAAGATTTTCATAGATCAGTG.......................... -300 -290 -280 -270 -260 -250 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub ATGCTCAGGAGTCGGCTGATCTGGATTTCCCTGTCCCAGATTGATAACGTCATGTCCTTC hal ...................................CCATATTGAAAATGGC......... -240 -230 -220 -210 -200 -190 <<<<<<<<<<<<<< <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub TGCAAGCTTTCGGT-TCACTTTCTGCACCAGAGAAGCGAAGAATTGTTTAGGCAATTCCT hal ......CTTTCGTTGTCATTTTC........................TAACGCAAAGCCT -180 -170 -160 -150 -140 -130 < <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub T-CAATACATGAGACTGTTCAAATTTCATCTATTCTCACCTTCTAAAAAAATCTTGAAAT hal CGCATTATATCGAGCGCTTCAATTCGGTTTGATTCTAACGT......AAGATTTTCATAG -120 -110 -100 -90 -80 -70 sub GATAGTCCATCATCATATATGGTTAAATGAAAAAAGTAAA-GAAAAATTTGGGGTGTTAA hal ATCAGTGTAACGAAAAAAATGGTTTTATTCTACTATTAAATGAAATATGTTGAAGGTT.. -60 -50 -40 -30 -20 -10 sub AAAG hal .... -1 > : other CDS - : gaps within a similar region ] : terminator . : gaps between similar regions } : RNAs @ : known binding sites <,[,{ : opposite direction About alignment...