Similar regions between promoters of yoqW
<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub ATTTCTGTTTACTTATTTCTTCTAATTTTATTTTTATCCAACAAATCAATAATGTAAGTT ste ........TTAGTTTTTTGCTCAAA.TTTATTTCCATCGAGCTAATGA............ -300 -290 -280 -270 -260 -250 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub TCAAACATGTCATCCCAATAAGGATCTGTTCTCGCTATGTATTTCTTTGTTCTTCCGTTC ste ............................................................ -240 -230 -220 -210 -200 -190 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< <<<<<<<<<<<< sub TCCTCAATCTTAAAGGTTTGCCCCTTTTGAATATCGGTGAACTTTT--TCTTTCTCCATA ste ...................................GGTGAACTGATGCTCTTTTTCATTA -180 -170 -160 -150 -140 -130 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub TTCCCCTAATCAACACATCAACTTCTTTAACCTCAACTGTTTGCTGCGGCATCACATTCC ste TTACCCTT-TCAGCACATGA........................................ -120 -110 -100 -90 -80 -70 sub TCCTTTTTGATTTTCGTGTATCAAGCCTGTACAATATTCAAAAACCCTAAAGGATGATGA ste ..CTTTTTCATT.........................TCAAAAAGGAGAACAGACTAGGA -60 -50 -40 -30 -20 -10 sub AC ste AC -1 > : other CDS - : gaps within a similar region ] : terminator . : gaps between similar regions } : RNAs @ : known binding sites <,[,{ : opposite direction About alignment...