Similar regions between promoters of yrzK

<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub TTTTACTTCCGCTGTAATGCCGTAGCTAAGCCCTGGGCCGCTTCTGACGTTCATTTCATC ste ........................GCTTGGCCATGGGCC.......ACGGTCATTTTA.. -300 -290 -280 -270 -260 -250 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub TGTTGCGATGACCGCTTCTCCTTGAGCAGCTGTAACGGATGAAAAGGTCGGGAATAGCGC ste ............CACTTCGACTCGAGC................................. -240 -230 -220 -210 -200 -190 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< <<<<<<<<<< sub TGAGGTGAAAATAATACATACAATAAGGACAAAGTATT-TCTTGTTCATTGTGTCCTCCT ste ..AGGGGGAGACAATGTCTA-AATTTTTACAAGGTACGGTCATTTTAATCGCCGCTGGCT -180 -170 -160 -150 -140 -130 sub TTCTGATGATCATTAAAAAAGCATTCTTGTTTAATATCGTAAAGTCCTTTCTGATTTTTA ste TTATTACGAAAATT.............................GGCCTTGCATATATTGT -120 -110 -100 -90 -80 -70 sub AATAAAAATAAAATGATTTGTTTATACTAAGCGTAAATACAATCAAAAAGGTGTGCAAAT ste ATAAAAGATGGAGGCATTTG........................................ -60 -50 -40 -30 -20 -10 sub C ste . -1 > : other CDS - : gaps within a similar region ] : terminator . : gaps between similar regions } : RNAs @ : known binding sites <,[,{ : opposite direction About alignment...