Similar regions between promoters of yycC
<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub GTGCATCATCAAATCTGCCGCTTTTTGATACAGATCCCACTCCCCGATCGAAGCAAATTT ste ..............CTCCCGCTTTTT.................................. -300 -290 -280 -270 -260 -250 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub CCCCATCAGCTCCTGAAGCTTTAACCTCATTGCTATATATTCTTCGAAAGTGACAGCTTT ste ............................................................ -240 -230 -220 -210 -200 -190 <<<<<<<<<<<<<<<< <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub TTCAGTGTCTATTTGG--TGTTCCTTCAGCATTTGTTTTAATAAGGATAACGGTGCGTGC ste .TCAATGTCATTCTGCCTTCTTCCTTTCGCCTTTATT....................... -180 -170 -160 -150 -140 -130 << sub ATAAGAACCCTCCTTACCTCTTTTATAACGGTCATTTTCCGATTGCTCTATTCCTTTGTG ste .................................ATTTTCCGGGTGC.....TCTTTTGTG -120 -110 -100 -90 -80 -70 sub ACATCTTCTTACATTTCACATCTGATTCTTGTACAATGGACAGAAGAGAGGAGGGATCTT ste AGCTGCACATCCAATTCA.............TACTATGAACAAACGAGGTGAG....... -60 -50 -40 -30 -20 -10 sub TT ste .. -1 > : other CDS - : gaps within a similar region ] : terminator . : gaps between similar regions } : RNAs @ : known binding sites <,[,{ : opposite direction About alignment...