Similar regions between promoters of comEA
<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub GCGGCTTAACACAAATAAAAATCATCTCGTTTTCAGAAACGAGCTTTTCGAGACTTTCGG hal ............................................................ ste ...........................CGCTTTCGCAAGCGTACGGTTCGTGA....... -300 -290 -280 -270 -260 -250 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< <<<<<<<<<<<<<<< <<<< sub TAACGTTTATGCTGTTGTAGCGGTTTTTTATGTGCA--ACGCTTTTTCAATTG---TGCG hal ............TGTTGAAACTGTTTTTGCGCTTGACGATGCTTTTTGATTTGGTCTGCA ste .........................TTGTATCGCGA--ACGCTTTCGCAAGCG---TACG -240 -230 -220 -210 -200 -190 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub GTTTGTGATTGTCATGTTTGAGGGATCGGCCGCTTTTGATTCAATAAATGATTCGATAAG hal ATTTGTAAATGT..................CGCTTTTGATCCATTTGTTGA......... ste GTTCGTGATGACGAGCTGATCCGCTTTCACGGCGCCGGAGTCGAGGAACGCTTCGATTAA -180 -170 -160 -150 -140 -130 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub GATCGTACCCATATTTCCTGTGCCGATAAAGCCTATCTTCAATGGTT-TCCCCTCC--TT hal ...................................TTTTCGATCGCT-TCCTCTCGCTTT ste GATGGTGCCCATATTCCCCGTGCCGATGACGCCGATGTTCATGTGTTGTCCCCCCC--T. -120 -110 -100 -90 -80 -70 sub TGAGCTATTATCCTCTAAACCATATGTGTTATGAAAATAAAATATGACGAAAGCGGGGAA hal TGATCCATT................................................... ste ...................CGATATGTATGAGAAAAA....................... -60 -50 -40 -30 -20 -10 sub CATGCACG hal ........ ste ........ -1 > : other CDS - : gaps within a similar region ] : terminator . : gaps between similar regions } : RNAs @ : known binding sites <,[,{ : opposite direction About alignment...