Similar regions between promoters of yitV
<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub CTCCATCTGCTGGTAGTACATGGAACTTGAACGATACGGACGGCCTGTTGAGATGCAGAC hal .............................AACGAAACGAATCTCCATTGGTCATCCAGA. ste ..........TCGTAGTACATGGAGCTTGCCCGGTACGGGCGGCCGGTGGCGATGACAAC -300 -290 -280 -270 -260 -250 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub ATAATGCCCGTCATCTTTTAGGCGCTGTATCGTATGAAGGGTGTTTTCAGATATGGTTTT hal ............................................................ ste AAAATGGCCGGTGTCGATGGCGCGGCGGATGACGTCTTTGGTAAATGGAGAAATCGTTTT -240 -230 -220 -210 -200 -190 <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< sub ATCATCCTTTAATAATGTTCCATCTAAATCTAATGCGATTAAATAGGGTTTTGTCTCCAT hal .....CCTTTTATAAT............................................ ste ATCCTCTTTGAGCAACGTTCCATCCAAATCCAACGCGATTAAATACGGCTTCATGTCC-- -180 -170 -160 -150 -140 -130 sub GAAAAGCTCCTTTAACCTTAGATTTTGCTTGTTTTGCCTTACTTACAGTGTAGCTTTTTA hal .AAGAACGCATGAAGCCTTAAATGTTGCTT................AATGTTGCTTCATG ste GA----CTCCTTTGCCCTCG--TTATTCTT----TACACTACAT--AGTGTAACTCTTTT -120 -110 -100 -90 -80 -70 sub CCATCTTTATTGTCTACATGTTACACTTATGATTAT-GGTTATCCTAAGGAGGGGCACAT hal CGATTTTTCTTTTTGAGAGCCACCTTTTATAATCAAAGGATAGCCGTATGAG........ ste CCAAAATCGCTGTCCATATGGTAAACT................................. -60 -50 -40 -30 -20 -10 sub T hal . ste . -1 > : other CDS - : gaps within a similar region ] : terminator . : gaps between similar regions } : RNAs @ : known binding sites <,[,{ : opposite direction About alignment...