araE_1 | -AGATTATTCTAT-----ATTTGTACGTACTAAT-----TAAATGTAATTT--- |
araE_2_compl | ---TTAAACCTTC-----AATTGTACGTACTTAT-----ATTAAAATTTA---- |
araR | -TGATATACTGAA-----ATTTGTCCGTATACAT-----TTTGGAGGAATG--- |
araA_1 | ATTACTATAATAA-----AATTGTTCGTACAAAA-----TATTTATTTATAGGT |
araA_2 | --ATTTTCCTATC-----ATTAGTACGTATCTTT-----TGTATTTGAAAGCG- |
xsa_1 | --------TATAA-----ATACATACGTACAAAT-----ATAAAAACAAT---- |
xsa_2 | ----CCATATTAT-----ATATGTTCGTACATGT-----CAACGAC-------- |