PerR

We searched for PerR binding sites in the upstream region of orthologous genes using the Position-Specific Scoring Matrix for PerR.

Transcription Factor Regulated gene organism position cis-element score
PerR fur Bha -48..-63 TTATAAATAGTATAG 6.904560
PerR fur Cac -65..-50 ATATAATTAGTATGA 6.086240
PerR fur Lla -98..-113 TTAGAATGATTCTAA 9.754070
PerR fur Lin -38..-23 GTATTATGAATATAA 5.750210
PerR fur EcZ -98..-83 TATTAATTATTATCG 6.157880
PerR fur Ecs -98..-83 TATTAATTATTATCG 6.157880
PerR fur Hpy -84..-99 TCATTATTATTTTAA 5.861980
PerR fur jHp -84..-99 TCATTATTATTTTAA 5.861980
PerR fur Syn -23..-38 TGATAATGATTATCG 9.208070
PerR fur Nos -77..-92 TGAGAATATTTATTA 6.635810
PerR hemA Bsu -79..-64 TTATAATTATTATAA 12.787040
PerR hemA Bha -237..-252 GAATTATTATTATAA 5.967840
PerR hemA Cac -57..-72 GTATAATTATACTAA 5.861980
PerR katA Bsu -63..-78 TTATAATTATTATAA 12.787040
PerR katA Bha -53..-68 TGGAAATTTTTATGA 5.785320
PerR katA Ype -234..-219 TTCAAATGATCATAA 6.092870
PerR katA Hin -10..-25 TTGTAAAGTTAATAA 6.420230
PerR katA Nme -191..-206 TTAATATTATTATAA 8.324020
PerR katA NmA -191..-206 TTAATATTATTATAA 8.324020
PerR katA Hpy -229..-244 CTACAATTATTTTTA 5.725600
PerR katA jHp -12..-27 TTGTCATTTTTTTAA 6.532000
PerR mrgA Bsu -83..-68 TTATAATTATTATAA 12.787040
PerR mrgA Spy -142..-157 TTAGAATCATTATCG 7.952430
PerR mrgA Mpu -66..-81 TTAAAATTCTTATAT 6.310500
PerR mrgA Ype -166..-181 TTATAAATAATATAG 6.904560
PerR mrgA Hin -239..-254 TTATAATTTTTAATA 8.049980
PerR mrgA Cje -109..-94 GTATAATGATTTTAA 8.093850
PerR mrgA Nos -15..-30 GAGTAATTATTATTA 6.330700
PerR mrgA Fnu -135..-150 TAATAATTATAAAAA 5.861980
PerR ahpC Bsu -60..-45 TTAGAATTATTATTG 9.611060
PerR ahpC Bha -100..-115 TTATAATTGATATTA 6.920800
PerR ahpC Spy -208..-223 ATATAATTGTTATTA 7.026660
PerR ahpC Lin -100..-85 TTATAATTACTATAA 10.443400
PerR ahpC Pae -205..-220 TTCTCATTATTATTA 6.920800
PerR ahpC Rpr -67..-52 TTATTATTGTAATAA 5.980380
PerR ahpC Rco -61..-46 TTATTATTGTAATAA 5.980380
PerR ahpC Tma -23..-38 TTAAAATGATTCTAA 8.212250
PerR ahpC Fnu -71..-56 TTGTAATGATTACAA 9.754070
PerR perR Bha -48..-63 TTATAAATAGTATAG 6.904560
PerR perR Cac -65..-50 ATATAATTAGTATGA 6.086240
PerR perR Lla -98..-113 TTAGAATGATTCTAA 9.754070
PerR perR Lin -38..-23 GTATTATGAATATAA 5.750210
PerR perR EcZ -98..-83 TATTAATTATTATCG 6.157880
PerR perR Ecs -98..-83 TATTAATTATTATCG 6.157880
PerR perR Hpy -84..-99 TCATTATTATTTTAA 5.861980
PerR perR jHp -84..-99 TCATTATTATTTTAA 5.861980
PerR perR Syn -23..-38 TGATAATGATTATCG 9.208070
PerR perR Nos -77..-92 TGAGAATATTTATTA 6.635810
PerR ykvW Bsu -167..-182 TAATAATTATCATTA 6.802400
PerR ykvW Bha -206..-191 CAATAATTTTTATTA 6.960640
PerR ykvW Lla -103..-88 TTGTAATATTTATAG 8.039030
PerR ykvW Spy -97..-82 TTAGAATGTTTCTAA 8.763870
PerR ykvW Lin -87..-102 CAATAATTATTATAA 9.354060
PerR ykvW Pmu -45..-30 TTATTATTCTTATTG 5.725600
PerR ykvW Cje -18..-33 TTATAATTATAAACA 7.022960
PerR ykvW Bbu -64..-79 TTATATATGTTATAA 5.980380
PerR ykvW Syn -25..-10 TTGTACTGAGTATTA 6.007210
PerR ykvW Tma -40..-25 CTACAATTAGTATAG 5.933620
PerR ykvW Fnu -72..-87 TTATTTTGATTATAT 5.750210