Phylogenetic profile
:
SigF
Orthologous information of transcription factor. (
Explanation
of these marks.)
TF
COG
Orthologs
SigF
COG1191
+
+
+
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
.
.
Orthologous information of regulated genes. (
Explanation
of these marks.)
Regulated operon
Regulated gene
Orthologs
csbX-bofC
bofC
No ortholog data.
csfB
csfB
No ortholog data.
csfC
csfC
No ortholog data.
dacF-spoIIAAB-sigF
dacF
*
*
*
+
*
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
.
gerAABC
gerAA
No ortholog data.
gpr
gpr
No ortholog data.
katX
katX
*
*
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
lonB
lonB
*
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
+
.
.
rsfA
rsfA
No ortholog data.
spoIIGA-sigE-sigG
sigG
*
+
*
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
*
+
+
.
.
spoIIQ
spoIIQ
*
*
+
+
.
.
*
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
*
+
*
+
+
+
spoIIR
spoIIR
No ortholog data.
spoIVB
spoIVB
*
*
*
+
+
*
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
sspN-tlp
sspN
No ortholog data.
yfhFED
yfhD
No ortholog data.
yhcM
yhcM
No ortholog data.
yhcN
yhcN
No ortholog data.
yhfM
yhfM
No ortholog data.
yhfW
yhfW
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
.
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
.
+
ylbBC
ylbB
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
yphA-seaA
yphA
No ortholog data.
yqhQP
yqhQ
+
+
+
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
yqzG
yqzG
No ortholog data.
yrrRS
yrrR
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
ytfIJ
ytfI
No ortholog data.
ytkD
ytkD
+
*
+
+
*
+
*
*
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
*
+
*
+
+
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
*
+
+
+
+
yuiC
yuiC
+
+
+
+
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
+
ywhE
ywhE
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
*
+
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
ywnJ
ywnJ
No ortholog data.
yyaC
yyaC
No ortholog data.
Copyright: Human Genome Center, Inst. Med. Sci., Univ. Tokyo; 1999-2005
Contact:
Kenta Nakai
