Phylogenetic profile
:
SpoIIID
Orthologous information of transcription factor. (
Explanation
of these marks.)
TF
COG
Orthologs
SpoIIID
-
No ortholog data.
Orthologous information of regulated genes. (
Explanation
of these marks.)
Regulated operon
Regulated gene
Orthologs
asnO
asnO
+
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+
+
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+
+
+
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+
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bofA
bofA
No ortholog data.
cotA
cotA
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*
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+
+
+
+
+
+
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cotC
cotC
No ortholog data.
cotD
cotD
No ortholog data.
cotF
cotF
+
+
+
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+
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cotJABC-yesJK
cotJA
No ortholog data.
cotT
cotT
No ortholog data.
cotVWX
cotX
No ortholog data.
gerE
gerE
+
+
+
+
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+
+
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*
*
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+
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*
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gerM
gerM
+
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spoIID
spoIID
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yqhV-spoIIIAABCDEFGH
spoIIIAA
+
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spoIVA
spoIVA
No ortholog data.
spoIVCA
spoIVCA
*
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*
*
*
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+
spoIVCB-spoIIIC
spoIVCB
+
+
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+
+
*
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+
+
+
+
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spoIVFAB
spoIVFA
+
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+
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+
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+
+
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+
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+
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+
+
+
+
+
+
+
+
+
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+
spoVB
spoVB
+
+
+
+
+
+
+
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spoVD
spoVD
*
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+
+
+
+
+
+
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+
+
+
+
+
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+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
murE-mraY-murD-spoVE-murG-murB-divIB-ylxWX-sbp
spoVE
+
+
+
+
+
+
+
+
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+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
spoVK
spoVK
+
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+
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+
+
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+
spoVM
spoVM
No ortholog data.
yabMNOPQ-divIC-yabR
yabP
No ortholog data.
ybaN
ybaN
+
+
+
+
+
+
+
+
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+
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+
+
+
+
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+
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+
+
+
+
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+
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+
ycgFG
ycgF
+
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+
+
+
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+
+
+
+
+
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+
yitE
yitE
+
+
+
+
+
+
+
+
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+
+
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ykvUV
ykvU
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+
ylbJ
ylbJ
+
+
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ypjB
ypjB
No ortholog data.
yqfCD
yqfC
No ortholog data.
yqfZY
yqfZ
No ortholog data.
Copyright: Human Genome Center, Inst. Med. Sci., Univ. Tokyo; 1999-2005
Contact:
Kenta Nakai
