| aldY | --ATT--------CGTTTAC---------ATATTGGCTTCAGC---------GGAAATA-------GAAGAAGACA----- |
| bmrU | --TCTT-------CGTTTAC--------TGCTTACAGAAAAAG---------GGGATTA-------TATAACC-------- |
| clpC | --TCA--------GGTTTTG--------TGGACCGGGAAAAT----------GGAAATA-------A-------------- |
| csbA | --ATGG-------TGATTGA--------TTTTGGCTGAAAAG----------GGGTATG-------GTGTAAGTAGA---- |
| ctc1 | --CGA--------GGTTTAA--------ATCCTTATCGTTAT----------GGGTATT-------GTTTGTAATAG---- |
| ctc2 | --TCGA-------GGTTTAA--------ATCCTTATCGTTAT----------GGGTATT-------GTTTGTAATAGG--- |
| dps | --AAGA-------GGTTTTA--------GCGTACGATATTAA----------GGGTATA-------CATAGTCATATA--- |
| gsiB | --TGTT-------TGTTTAA--------AAGAATTGTGAGC-----------GGGAATA-------CAACAACCAAC---- |
| gspA1 | --ACG--------TGTTTAT--------TTTTTTGAAAAA------------GGGTATG-------TAACTTGTAC----- |
| gspA2 | --AACG-------TGTTTAT--------TTTTTTGAAAAA------------GGGTATG-------TAACTTGTACA---- |
| gtaB | --AAAA-------TGTGTAA--------AAACATATTGAAAA----------GGGTAAA-------TAGAGAATAGT---- |
| katB | --TAGC-------AGTTTAT--------ATGAAGAACGCCAC----------GGGTAAA-------TGTGCTGTAGAA--- |
| katX | AAAAAACGGC---TGTTTTA--------AAATCTTTCCATTCA---------GGGAATA-------TTGTTACCGTTCAA- |
| lctE | --AAT--------TGAATTG--------ACCGGATCTTGGCC----------TGGAAAA-------CCAATGACTAA---- |
| opuE | --CAA--------TGTTTCA--------TCGCTTGAATGGCC----------GGGAATA-------CT------------- |
| ptb | --TTCGG------AATTTAT--------ATTACAAAAT--------------GGATAAA-------TATGGCCTTGC---- |
| sigB | --GAAA-------GGTTTAA--------CGTCTGTCAGACGA----------GGGTATA-------AAGCAACTAGT---- |
| spoVG | --CGAGCA-----GGATTTC--------AGAAAAAATCGT------------GGAATTG-------ATACACTAATGC--- |
| trxA1 | --TTCA-------GGTTTTA--------AAACAGCTCCGGCA----------GGGCATG-------GTAAAGTACAT---- |
| trxA2 | --TCA--------GGTTTTA--------AAACAGCTCCGGCA----------GGGCATG-------GTAAAGTACAT---- |
| yabJ | --ATG--------AGTTTAA--------CGCAAATGTGGC------------GGGAATC-------GGCGTCTTAGT---- |
| yacL | --TTTC-------GGTTAAA--------ACCTTATGAATAC-----------GGGTATA-------TTAATGTTGGT---- |
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| yflA | --AAA--------GGTTTAT--------GTTTTTCCATCTAT----------GGGAAAT-------GATTCATAAAC---- |
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| yjbC | --GGC--------TGTTTAA--------ACAAGAAGAAATG-----------GGGTATA-------TCTAAAAGTAT---- |
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| yoxA | --AACGG------TGTTTTT--------TTATTTGATAG-------------GGGAAAA-------TATAAAATGGA---- |
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| yvyD | --GATTTA-----TGTTTCA--------GCAGGAATTGTAAA----------GGGTAAA-------AGAGAAATAGATACA |
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