SigB alignment

Link to : Weight matrix

aldY--ATT--------CGTTTAC---------ATATTGGCTTCAGC---------GGAAATA-------GAAGAAGACA-----
bmrU--TCTT-------CGTTTAC--------TGCTTACAGAAAAAG---------GGGATTA-------TATAACC--------
clpC--TCA--------GGTTTTG--------TGGACCGGGAAAAT----------GGAAATA-------A--------------
csbA--ATGG-------TGATTGA--------TTTTGGCTGAAAAG----------GGGTATG-------GTGTAAGTAGA----
ctc1--CGA--------GGTTTAA--------ATCCTTATCGTTAT----------GGGTATT-------GTTTGTAATAG----
ctc2--TCGA-------GGTTTAA--------ATCCTTATCGTTAT----------GGGTATT-------GTTTGTAATAGG---
dps--AAGA-------GGTTTTA--------GCGTACGATATTAA----------GGGTATA-------CATAGTCATATA---
gsiB--TGTT-------TGTTTAA--------AAGAATTGTGAGC-----------GGGAATA-------CAACAACCAAC----
gspA1--ACG--------TGTTTAT--------TTTTTTGAAAAA------------GGGTATG-------TAACTTGTAC-----
gspA2--AACG-------TGTTTAT--------TTTTTTGAAAAA------------GGGTATG-------TAACTTGTACA----
gtaB--AAAA-------TGTGTAA--------AAACATATTGAAAA----------GGGTAAA-------TAGAGAATAGT----
katB--TAGC-------AGTTTAT--------ATGAAGAACGCCAC----------GGGTAAA-------TGTGCTGTAGAA---
katXAAAAAACGGC---TGTTTTA--------AAATCTTTCCATTCA---------GGGAATA-------TTGTTACCGTTCAA-
lctE--AAT--------TGAATTG--------ACCGGATCTTGGCC----------TGGAAAA-------CCAATGACTAA----
opuE--CAA--------TGTTTCA--------TCGCTTGAATGGCC----------GGGAATA-------CT-------------
ptb--TTCGG------AATTTAT--------ATTACAAAAT--------------GGATAAA-------TATGGCCTTGC----
sigB--GAAA-------GGTTTAA--------CGTCTGTCAGACGA----------GGGTATA-------AAGCAACTAGT----
spoVG--CGAGCA-----GGATTTC--------AGAAAAAATCGT------------GGAATTG-------ATACACTAATGC---
trxA1--TTCA-------GGTTTTA--------AAACAGCTCCGGCA----------GGGCATG-------GTAAAGTACAT----
trxA2--TCA--------GGTTTTA--------AAACAGCTCCGGCA----------GGGCATG-------GTAAAGTACAT----
yabJ--ATG--------AGTTTAA--------CGCAAATGTGGC------------GGGAATC-------GGCGTCTTAGT----
yacL--TTTC-------GGTTAAA--------ACCTTATGAATAC-----------GGGTATA-------TTAATGTTGGT----
ycnH--AAC--------GGATTAC--------TTTTGCTGACAGC-----------GGGAATT-------AACGGTAATAT----
ydaD--AGCCA------TGTTTAT--------CCAAAGAGTGTGTGA---------GGTACAC-------AACAAATA-------
ydbP--CTT--------TGATTAC--------AGCCAGAGCTGTCTGCA-------GGGAAAC-------ATTATGTTCTG----
ydhK--TTA--------TGTTTGG--------CTTTGCAAACAAAG----------GGGAATA-------GGACAAACTGC----
yfhK--ACA--------TGTTTCA--------CCAGCCTGTCAATCA---------GGGAATA-------CCACTTATATC----
yflA--AAA--------GGTTTAT--------GTTTTTCCATCTAT----------GGGAAAT-------GATTCATAAAC----
yhaR--AAA--------GGTTTAT--------TTGGGGATGGCG------------GGGAATG-------TATAGGAGAAA----
yjbC--GGC--------TGTTTAA--------ACAAGAAGAAATG-----------GGGTATA-------TCTAAAAGTAT----
yjgB--ACA--------TGTTTCG--------TTGCAAAAACACG-----------GGGAAAC-------GGAATGGTAGA----
ykgA--AAT--------GGTTTAA--------TGATTTTCATGATGA---------GGGAATA-------ATAAATGTATT----
yotK--TCT--------AGTTTCT--------CTTTTTAAAAGAGTA---------GGGTATT-------GCAAACAACAG----
yoxA--AACGG------TGTTTTT--------TTATTTGATAG-------------GGGAAAA-------TATAAAATGGA----
yoxC--TTC--------TGATTAA--------AAAAACGGATACA-----------GGGTAAT-------GACATAAGAAA----
ypuB--TGC--------TGATTAT--------ACAAAAAGTGGATT----------GGGAATG-------ATAAAAGAACA----
yqhA--TTC--------GGTTTTT--------CACCTGTCCAGAAACT--------GGGCTAG-------CTGGATTCGAAC---
yqhQ--CTG--------CGAGTAA--------AATTTGAAAATAAC----------GGGTATA-------ATGCATGTAGG----
yqhZ--AGG--------TGTGTGA--------AAATATTCGGTAATA---------GGGTAAA-------AAAACCTTGAT----
yqxL--ACT--------GGTTTAG--------TGACGCGGTTATT-----------GGGCAAT-------TAAAGAATAAA----
yrvD--CCA--------TGTTTAA--------AACCAGTCTTGATT----------GGGAAAG-------TTACCTCAATA----
ysdB--ATACGAC----TATTTCA--------CTTGAAAATC--------------GGGTATA-------TGTTTTTACAG----
ytkL--ATA--------AGTTTTT--------CAGCTTTTTAAAAA----------GGGAAAA-------TAAAAAAAACA----
ytxG--ACA--------TGTTTAT--------GATTGAAGAAAAC-----------GGGTAAA-------CA-------------
yvrE--AGT--------GGTTTGG--------ACACCTCTTTGCC-----------GGGAATA-------ACAATATATAG----
yvyD--GATTTA-----TGTTTCA--------GCAGGAATTGTAAA----------GGGTAAA-------AGAGAAATAGATACA
yxkO--TTT--------TGTTTGA--------AAAAGAAAAGGGAC----------AGGAAAA-------ATAGGAAAAGA----
yycD--GAT--------CGTTTCG--------GACAGTAACAAGGC----------GGGAAAA-------ATGCAATAAAA----
yelA--TTT--------GCATTTA--------TTTTATATAATATTT---------GGCTATT-------TGAACTTCTGCT---
ydaP--TCCG-------GGTTTTA--------AAGCCTTTCTCCTG----------TGGTATT-------GAAAAAAGG------
ydaS--AAG--------TGTTTCG--------AAATGATCAGGAG-----------CGGTTAT-------TGATTGGTAAAT---
ydaT--ATG--------CGTTTTT--------ATTTTTCACCTGC-----------GGGTACC-------ATTTTTATAAA----
yhdF--TGG--------CGTTTAT--------TCATTTCTGTCGTG----------TGGTAAC-------GTTCAGTATCA----