SigE alignment

Link to : Weight matrix

bofA-------AGTG--GTCTAAAC--TCCTGGATCTTCT--CATAAGCT--TGTACTAG------------
cotE--------TAA--GTAAAGTT--TCTAGGCACCCCTG-CATACAAT--GGAACAGAAA----------
cotE-------AAAT--GCACACTA--GACAAATGCCCAG--CATAAGAT--AACACGAA------------
cotJA-------TTAG--TCATAATC--ATGCCTCCTGCCT--CATACCTA--TTAAGGTCATT---------
cwlD-------GTAA--TCATATTT--CCCGACCCTGTCC--CATAGTTA--TGTAATAACGGACAAG----
cwlJ-------TCCG--TCATCACT--TCTGAAGTAATGA--AATATGAT--GAAAAGAGATCAAGGG----
dacB-------TTAT--TCATAACT--GATGGACATGCG---CATAAACT--TGTACAAACCA---------
gerM-------TTCG--GTCTATTT--CCTAAAGAGGCTCG-TATACATA--ATAGTA--------------
glgB-------CTTC--GAATAAAT--ACTATAAATGAAA--ACTATGAT--GTCAGAAAGG----------
mmgA-------TCAT--TCATTCAT--GCCCGTTTCAAAG--CATACATT--CATAGAAGAC----------
nucB-------TTAA--AAATATTC--TTCATCAAGCGCC--CATACATT--GAAATGAACAAA--------
paiB------AACGG--ATTTAATC--ATGGCTAAAACACT-CATATAAT--ATTTTTCGAAG---------
phoB----------C--TAAAACTT--CTCATAAAAGAA---TAACCATT--ATTTAAGGGTGCCAGTTCAT
prkA-------CAAA--GCATGTAT--CACGAGATGGCGG--CATAGATT--GTATCA--------------
spoIID-------AGAG--TCATATTA--GCTTGTCCCTGCC--CATAGACT--AGACTAGAGT----------
spoIIIAA-------CTTG--TCATAAAG--TCTGCCTCACAT---CATACATT--TTAAAGAAGC----------
spoIIID-------TTTA--GCATATTC--CCAAAAGAATGCT--AATACACT--GTTACAAACC----------
spoIIM-------AAGG--GCATGTTT--TTCTGTTTCTTT---CATACAAT--CTATTAAATC----------
spoIIP-------ACAG--TTCTACTT--CCTCTAGCTTGTT--CATAGAGT--AATTACTAGAC---------
spoIVA-------AAAG--GAATGAAC--CTTTCTCCCTTG---CATACAAA--TAGGGAGAAA----------
spoIVA-------GATG--TCATATTC--AAATAGGACAACGT-CATACACA--TATAGTGTCC----------
spoIVCA--AAAATCTCC--TCATTTGG--ACAAACAGCTGTTA-CATAGCAT--TACCCAAGGGG---------
spoIVCB-------ACAG--ACACAGAC--AGCCTCCCGGTCA--CATACATT--TACATATAG-----------
spoIVFA-------AACC--GAATATTT--GCCATGGACAAGA--CATATGAT--GTACAAACCC----------
spoVB-------CTTG--TCATGCTT--GGACGACATATACG-CATATCTT--TATTGTATA-----------
spoVD-------ATCG--TTCTACCT--GTCCAAATTCAGG--CATAAAAT--GAAACAAGCCT---------
spoVE-------GGTG--ACATGTTT--ATAGATGCCGTG---CATATGCT--TAAGTAAGGGC---------
spoVE-------CTGG--GAATACAA--CATGTCAAACGTG--TCGATAAT--GTTGAACAAGCAGTAT----
spoVID-------CCAC--TCATATTT--TCTCCAGTTCATA--CATACACC--TTTAGTGACAT---------
spoVK-------CATG--GTTTGTCC--ACCCCATGTCCGTG-AATACAAT--AAGAAATAA-----------
spoVM-------GAGG--TACTTTTT--CGTTTGCAAAAGG--CATATTAA--TAATGATAAGA---------
spoVR-------ACTA--TCATCTTT--TGTCTGGCGGGCT--CATACATT--ATAGATAAGT----------
yaaH-------ATAA--ACATGATC--AGCGCTTTTCTTT--CATACATT--GATAGCGATA----------
ybaN-------TCGG--TTATATTC--AATTGTCCATGCT--CATAAGAT--GTAAA---------------
ycgF-------TTGT--GCATAGCT--TGGCCCGTTCCCG--AATAAATT--GTACAA--------------
ydcA-------TACG--TACTATTT--AAATGGTTTGTCT--CATAAACG--TGTTAC--------------
ydcC-------GTCT--GCATATTA--GGGAAACCCCACT--CATATATT--TGATAG--------------
yfhS-------TAGC--GTATAGTT--CTTTTATTTCCA---CAAACAAT--AATGGCAAGAACTTTAA---
yhaX-------GTTG--TTCTAAAC--ACAGAGACAGGGT--CATATCCT--ATACAC--------------
yhbH-------GTTT--GTCAATTA--AACGTGCATATGTG-CATATGAT--GAATAT--------------
yjbX-------TTTC--TTCTGATT--TTCAGCTTTCTGT--CATATAGA--TAGAAT--------------
yjmCTATAATATAAA--GAATATTT--AAAATAATTTGTA--AATAAAAT--GTGTTTGTA-----------
yknT-------AGAG--GAATAGCT--GTTCAGTATTTG---CATATTGT--AGTGTTAACAT---------
ykvI--------TTC--GTCTTTTC--AAGGAACTTGTCT--CATAGGTT--ATAAAA--------------
ykvU-------AATA--AAATAATT--TTTGAACTTGTCT--CATATGAT--GTTGGT--------------
ylbJ-------TATG--GTCTAAAC--TGAACCCCTATGCT-CGTATATT--AGTACA--------------
yngJ-------CAGG--GAATGATT--ATAGAACTCGCCT--AATAGGAT--GTTACA--------------
yoaW-------GCCT--GAATATTT--CTTTGAGCTAATG--AATACAAT--AAATCGATAG----------
ypjB-------GTTG--GTCTATCC--TTGTCCCTTTCTT--CATATTCT--GTAAGG--------------
yqfC------AAAGT--GTTAGAAC--CTCCTTTCAAAT---CATACACA--TGAGAT--------------
yqfZ-------TTTG--TCATGAAT--CGAAATGGACAAG--CATACTAT--GGTATA--------------
yrbA---TCCTTTAC--TCATAACT--TCTTTTGTTCAGG--CATATGTT--GTGAAGAAA-----------
yteV-------TCTA--TCATAACG--CTGTTCCAAACGG--AATAGATT--GATAGAGAAAG---------
ytrH-------ATCA--TCATACTT--GTCCTGAAAGCTC--AATATGAT--ATAAAA--------------
ytvI-------GTAT--TCATATTC--AGCCGCAGCGTG---AATACATA--TAAAAA--------------
ytxC-------TTAC--GTCTATTT--TAAAAACATCCCC--CATATACT--TGTAAC--------------
yunB-------CTAT--TACTATGT--CCCCTCTTACAAG--CATACATT--GTGATA--------------
yuzC-------TTTG--TCATATTC--GGCAATTAGGGATC-TATACATA--TAGAAA--------------
yxiC-------ATCG--GAATAGTT--GGCCCACGCTTCT--CGTACATA--TGGAAA--------------
yyaD-------TATG--GCATGTTT--GCTTTCCTTTATT--TATATAGT--AACAAT--------------
yybI--------TAT--GTCTTTGA--TGTGCCATTCCTG--CATATAAT--GATTCA--------------