| bofA | -------AGTG--GTCTAAAC--TCCTGGATCTTCT--CATAAGCT--TGTACTAG------------ |
| cotE | --------TAA--GTAAAGTT--TCTAGGCACCCCTG-CATACAAT--GGAACAGAAA---------- |
| cotE | -------AAAT--GCACACTA--GACAAATGCCCAG--CATAAGAT--AACACGAA------------ |
| cotJA | -------TTAG--TCATAATC--ATGCCTCCTGCCT--CATACCTA--TTAAGGTCATT--------- |
| cwlD | -------GTAA--TCATATTT--CCCGACCCTGTCC--CATAGTTA--TGTAATAACGGACAAG---- |
| cwlJ | -------TCCG--TCATCACT--TCTGAAGTAATGA--AATATGAT--GAAAAGAGATCAAGGG---- |
| dacB | -------TTAT--TCATAACT--GATGGACATGCG---CATAAACT--TGTACAAACCA--------- |
| gerM | -------TTCG--GTCTATTT--CCTAAAGAGGCTCG-TATACATA--ATAGTA-------------- |
| glgB | -------CTTC--GAATAAAT--ACTATAAATGAAA--ACTATGAT--GTCAGAAAGG---------- |
| mmgA | -------TCAT--TCATTCAT--GCCCGTTTCAAAG--CATACATT--CATAGAAGAC---------- |
| nucB | -------TTAA--AAATATTC--TTCATCAAGCGCC--CATACATT--GAAATGAACAAA-------- |
| paiB | ------AACGG--ATTTAATC--ATGGCTAAAACACT-CATATAAT--ATTTTTCGAAG--------- |
| phoB | ----------C--TAAAACTT--CTCATAAAAGAA---TAACCATT--ATTTAAGGGTGCCAGTTCAT |
| prkA | -------CAAA--GCATGTAT--CACGAGATGGCGG--CATAGATT--GTATCA-------------- |
| spoIID | -------AGAG--TCATATTA--GCTTGTCCCTGCC--CATAGACT--AGACTAGAGT---------- |
| spoIIIAA | -------CTTG--TCATAAAG--TCTGCCTCACAT---CATACATT--TTAAAGAAGC---------- |
| spoIIID | -------TTTA--GCATATTC--CCAAAAGAATGCT--AATACACT--GTTACAAACC---------- |
| spoIIM | -------AAGG--GCATGTTT--TTCTGTTTCTTT---CATACAAT--CTATTAAATC---------- |
| spoIIP | -------ACAG--TTCTACTT--CCTCTAGCTTGTT--CATAGAGT--AATTACTAGAC--------- |
| spoIVA | -------AAAG--GAATGAAC--CTTTCTCCCTTG---CATACAAA--TAGGGAGAAA---------- |
| spoIVA | -------GATG--TCATATTC--AAATAGGACAACGT-CATACACA--TATAGTGTCC---------- |
| spoIVCA | --AAAATCTCC--TCATTTGG--ACAAACAGCTGTTA-CATAGCAT--TACCCAAGGGG--------- |
| spoIVCB | -------ACAG--ACACAGAC--AGCCTCCCGGTCA--CATACATT--TACATATAG----------- |
| spoIVFA | -------AACC--GAATATTT--GCCATGGACAAGA--CATATGAT--GTACAAACCC---------- |
| spoVB | -------CTTG--TCATGCTT--GGACGACATATACG-CATATCTT--TATTGTATA----------- |
| spoVD | -------ATCG--TTCTACCT--GTCCAAATTCAGG--CATAAAAT--GAAACAAGCCT--------- |
| spoVE | -------GGTG--ACATGTTT--ATAGATGCCGTG---CATATGCT--TAAGTAAGGGC--------- |
| spoVE | -------CTGG--GAATACAA--CATGTCAAACGTG--TCGATAAT--GTTGAACAAGCAGTAT---- |
| spoVID | -------CCAC--TCATATTT--TCTCCAGTTCATA--CATACACC--TTTAGTGACAT--------- |
| spoVK | -------CATG--GTTTGTCC--ACCCCATGTCCGTG-AATACAAT--AAGAAATAA----------- |
| spoVM | -------GAGG--TACTTTTT--CGTTTGCAAAAGG--CATATTAA--TAATGATAAGA--------- |
| spoVR | -------ACTA--TCATCTTT--TGTCTGGCGGGCT--CATACATT--ATAGATAAGT---------- |
| yaaH | -------ATAA--ACATGATC--AGCGCTTTTCTTT--CATACATT--GATAGCGATA---------- |
| ybaN | -------TCGG--TTATATTC--AATTGTCCATGCT--CATAAGAT--GTAAA--------------- |
| ycgF | -------TTGT--GCATAGCT--TGGCCCGTTCCCG--AATAAATT--GTACAA-------------- |
| ydcA | -------TACG--TACTATTT--AAATGGTTTGTCT--CATAAACG--TGTTAC-------------- |
| ydcC | -------GTCT--GCATATTA--GGGAAACCCCACT--CATATATT--TGATAG-------------- |
| yfhS | -------TAGC--GTATAGTT--CTTTTATTTCCA---CAAACAAT--AATGGCAAGAACTTTAA--- |
| yhaX | -------GTTG--TTCTAAAC--ACAGAGACAGGGT--CATATCCT--ATACAC-------------- |
| yhbH | -------GTTT--GTCAATTA--AACGTGCATATGTG-CATATGAT--GAATAT-------------- |
| yjbX | -------TTTC--TTCTGATT--TTCAGCTTTCTGT--CATATAGA--TAGAAT-------------- |
| yjmC | TATAATATAAA--GAATATTT--AAAATAATTTGTA--AATAAAAT--GTGTTTGTA----------- |
| yknT | -------AGAG--GAATAGCT--GTTCAGTATTTG---CATATTGT--AGTGTTAACAT--------- |
| ykvI | --------TTC--GTCTTTTC--AAGGAACTTGTCT--CATAGGTT--ATAAAA-------------- |
| ykvU | -------AATA--AAATAATT--TTTGAACTTGTCT--CATATGAT--GTTGGT-------------- |
| ylbJ | -------TATG--GTCTAAAC--TGAACCCCTATGCT-CGTATATT--AGTACA-------------- |
| yngJ | -------CAGG--GAATGATT--ATAGAACTCGCCT--AATAGGAT--GTTACA-------------- |
| yoaW | -------GCCT--GAATATTT--CTTTGAGCTAATG--AATACAAT--AAATCGATAG---------- |
| ypjB | -------GTTG--GTCTATCC--TTGTCCCTTTCTT--CATATTCT--GTAAGG-------------- |
| yqfC | ------AAAGT--GTTAGAAC--CTCCTTTCAAAT---CATACACA--TGAGAT-------------- |
| yqfZ | -------TTTG--TCATGAAT--CGAAATGGACAAG--CATACTAT--GGTATA-------------- |
| yrbA | ---TCCTTTAC--TCATAACT--TCTTTTGTTCAGG--CATATGTT--GTGAAGAAA----------- |
| yteV | -------TCTA--TCATAACG--CTGTTCCAAACGG--AATAGATT--GATAGAGAAAG--------- |
| ytrH | -------ATCA--TCATACTT--GTCCTGAAAGCTC--AATATGAT--ATAAAA-------------- |
| ytvI | -------GTAT--TCATATTC--AGCCGCAGCGTG---AATACATA--TAAAAA-------------- |
| ytxC | -------TTAC--GTCTATTT--TAAAAACATCCCC--CATATACT--TGTAAC-------------- |
| yunB | -------CTAT--TACTATGT--CCCCTCTTACAAG--CATACATT--GTGATA-------------- |
| yuzC | -------TTTG--TCATATTC--GGCAATTAGGGATC-TATACATA--TAGAAA-------------- |
| yxiC | -------ATCG--GAATAGTT--GGCCCACGCTTCT--CGTACATA--TGGAAA-------------- |
| yyaD | -------TATG--GCATGTTT--GCTTTCCTTTATT--TATATAGT--AACAAT-------------- |
| yybI | --------TAT--GTCTTTGA--TGTGCCATTCCTG--CATATAAT--GATTCA-------------- |
Link to : Weight matrix