Phylogenetic profile
:
SigA
Orthologous information of transcription factor. (
Explanation
of these marks.)
TF
COG
Orthologs
SigA
COG0568
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
Orthologous information of regulated genes. (
Explanation
of these marks.)
Regulated gene
Orthologs
abnA
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
+
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
abrB
*
*
*
.
.
.
.
*
.
.
.
.
.
*
*
.
*
*
*
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
*
+
.
*
.
.
.
.
.
.
.
*
*
.
.
.
.
acsA
*
*
.
*
.
.
*
*
.
.
.
.
.
*
*
.
*
*
*
*
+
.
*
*
.
*
*
.
.
*
*
.
+
+
+
*
*
*
.
.
.
.
.
.
*
*
*
.
.
*
acuA
No ortholog data.
adaA
*
*
.
+
.
.
.
*
.
.
.
.
.
*
*
.
*
*
*
*
*
+
*
*
*
*
*
.
.
*
.
.
.
+
+
*
*
*
.
*
*
+
.
.
*
*
.
+
.
*
addB
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
ahpC
+
+
.
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
ald
*
*
.
*
.
.
*
*
.
.
.
.
.
*
*
*
.
.
.
.
.
.
*
.
.
.
.
.
.
.
*
*
.
.
*
.
*
*
.
.
.
.
.
.
*
*
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
.
*
*
.
*
.
*
*
*
*
*
+
*
*
*
*
*
.
*
.
.
.
.
*
*
*
.
*
*
alkA
*
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
*
*
.
*
*
*
*
+
+
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
*
+
+
+
*
.
.
*
+
*
*
*
*
.
.
.
*
alsS
*
*
*
*
.
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
*
*
*
*
*
*
*
.
.
+
+
+
*
*
*
.
.
.
.
.
.
*
*
*
*
.
*
amhX
+
+
+
+
.
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
.
.
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
amyE
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
.
+
ansA
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
.
+
*
*
.
*
*
*
+
*
*
+
*
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
*
*
aprE
*
*
*
.
*
*
.
.
*
.
.
+
*
*
*
*
.
.
.
.
*
.
+
*
.
.
*
*
*
*
.
.
*
*
+
.
*
.
.
.
.
.
.
.
*
*
*
.
*
*
araA
+
+
+
.
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
.
+
araE
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
araR
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
argC
*
*
*
*
.
.
+
+
.
.
.
.
+
*
*
*
*
*
*
*
+
+
+
*
.
*
*
*
+
*
.
.
+
+
+
+
+
*
.
.
.
.
.
.
*
*
+
*
.
*
arsR
No ortholog data.
asd
*
*
*
*
.
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
+
*
*
*
*
*
+
+
*
*
*
*
*
*
*
+
+
+
*
+
*
*
*
+
+
+
*
.
.
+
*
*
*
.
*
*
*
*
.
.
.
*
.
.
.
.
.
.
*
*
.
*
*
*
*
*
.
.
*
.
.
.
.
.
*
.
.
.
*
+
.
*
*
.
.
.
.
.
.
.
.
*
.
.
.
bglC
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
+
.
.
bglP
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
.
+
.
.
+
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
+
.
bsrB
No ortholog data.
ccdA
+
+
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
+
.
+
+
+
+
+
+
ccpC
No ortholog data.
cdd
*
+
*
+
*
*
*
+
*
+
+
*
.
*
*
*
*
*
*
*
*
.
+
.
*
*
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
*
*
.
.
.
.
.
*
.
.
.
*
.
*
cggR
No ortholog data.
citA
*
*
.
*
.
.
+
+
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
+
*
.
+
*
.
*
*
*
*
*
*
*
+
*
+
+
*
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
*
.
*
citB
*
.
+
+
.
.
*
+
.
.
.
.
+
*
*
*
*
*
*
*
+
.
+
*
*
*
*
*
*
+
+
+
+
+
+
+
*
*
*
*
.
.
*
.
.
.
*
.
*
*
citR
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
.
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
.
.
*
*
*
.
*
*
citZ
*
*
.
*
.
.
+
+
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
+
*
.
+
*
.
*
*
*
*
*
*
*
+
*
+
+
*
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
*
.
*
clpE
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
clpP
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
clpX
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
codV
+
+
+
.
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
.
+
+
+
.
+
+
comA
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
.
*
*
*
*
*
.
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
*
*
*
*
*
.
.
.
.
.
.
*
*
.
.
.
*
comC
*
*
+
*
*
*
*
+
.
.
.
.
*
+
+
.
*
*
*
+
*
.
+
+
+
+
+
*
*
+
.
.
*
.
.
.
*
*
.
.
.
.
.
.
*
*
+
*
.
*
comEA
*
*
*
*
*
*
+
*
.
.
.
.
*
*
+
.
*
*
*
*
+
.
+
*
*
*
*
*
*
*
.
.
*
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
*
*
.
*
*
*
comFA
*
*
+
*
*
*
+
+
*
.
.
*
.
.
.
.
*
*
*
.
*
.
*
*
.
.
.
.
+
+
.
.
*
+
*
+
*
*
.
*
.
.
.
.
*
*
.
.
.
.
comGA
*
*
*
*
*
*
*
+
*
.
.
*
*
*
*
.
+
+
+
+
+
.
+
*
+
+
*
*
*
*
.
.
+
*
+
*
*
*
.
.
+
+
.
.
*
*
+
*
*
*
comK
*
.
.
.
.
*
*
+
.
.
.
.
*
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
*
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
comQ
*
+
+
*
+
+
+
*
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
*
*
*
*
*
*
*
*
+
*
+
+
+
*
*
*
+
*
+
*
*
*
*
*
*
*
*
cspB
*
*
*
*
*
.
*
+
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
*
+
+
*
*
*
*
.
.
.
.
.
.
*
*
*
*
ctaA
*
*
.
.
.
.
*
+
.
.
.
.
+
*
*
*
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
*
.
.
+
.
.
.
+
+
+
*
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
.
.
*
ctsR
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
.
+
+
.
.
+
.
cysH
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
+
+
cysK
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
degQ
No ortholog data.
degS
*
*
*
+
*
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
+
+
*
+
+
*
.
+
*
.
*
.
.
.
*
.
.
.
*
*
+
*
*
.
*
.
.
.
.
+
*
.
.
*
*
des
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
dhbA
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
*
*
+
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
.
.
*
*
*
*
*
*
divIB
*
*
*
+
+
*
+
+
.
.
.
.
+
+
+
*
*
*
*
+
+
.
+
+
*
+
*
*
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
*
+
.
.
*
*
*
*
.
.
.
*
dnaA
*
*
*
*
*
*
*
+
*
+
*
+
+
+
+
+
*
*
*
*
*
+
+
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
+
+
*
*
*
*
*
*
+
*
*
*
*
*
.
*
dnaJ
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
dppA
*
.
.
.
.
.
.
*
.
.
.
.
.
.
.
.
*
*
*
*
*
.
+
+
.
.
+
+
*
+
.
.
+
+
+
+
*
+
.
.
.
.
.
.
+
*
.
.
.
*
drm
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
.
.
+
.
+
+
+
+
+
+
fabL
No ortholog data.
fbp
+
.
+
+
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
feuA
*
*
*
*
+
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
.
+
*
*
*
.
*
*
*
*
*
+
*
*
*
*
*
.
.
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
fhuD
*
*
*
*
+
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
.
+
*
*
*
.
*
*
*
*
*
+
*
*
*
*
*
.
.
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
flgB
*
*
*
*
*
.
.
*
.
.
.
.
*
.
.
.
*
*
*
*
+
+
+
*
.
.
.
.
.
+
*
*
+
+
+
*
*
*
.
.
*
.
*
*
.
.
+
*
.
*
ftsA
*
*
*
*
*
*
*
+
.
.
.
.
.
.
.
.
*
*
*
+
*
+
+
+
*
*
*
*
*
+
*
+
+
+
+
+
+
*
*
*
+
+
*
+
*
*
+
*
+
*
ftsH
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
fur
+
+
+
+
+
.
+
+
.
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
gabP
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
+
.
.
.
+
.
.
+
.
+
.
.
.
+
.
.
.
.
+
.
+
+
+
.
gabR
No ortholog data.
gabT
No ortholog data.
galE
+
+
+
+
.
+
.
+
.
+
+
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
gcaD
*
*
*
*
*
*
*
+
.
.
.
.
+
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
+
*
*
*
+
+
.
.
.
.
*
*
+
+
*
*
glnR
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
*
*
+
.
*
*
glpD
*
*
.
*
+
*
+
+
.
.
.
.
+
+
*
*
*
*
*
*
*
.
*
*
*
*
+
.
.
*
.
.
.
*
+
+
*
.
.
.
.
.
.
*
*
.
.
.
.
*
glpF
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
*
.
*
*
*
.
*
*
*
+
+
+
*
*
*
*
*
*
+
+
*
*
*
+
+
+
*
+
.
.
.
.
.
*
*
*
.
*
*
*
glpQ
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
.
*
*
*
+
+
+
+
*
*
.
*
*
*
*
.
.
.
*
.
.
.
+
+
+
*
*
.
.
.
.
*
.
.
*
.
+
*
*
glpT
*
.
.
*
*
.
*
.
.
.
.
.
.
.
.
.
*
*
*
*
*
.
*
*
*
*
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
*
*
*
*
.
.
.
.
.
.
.
.
gltA
*
*
*
*
.
.
*
*
.
.
.
.
+
*
+
*
*
*
*
*
*
.
+
*
.
.
+
.
.
*
.
.
+
*
+
*
*
*
.
.
.
.
.
.
*
*
*
*
.
*
*
*
*
*
.
.
*
*
.
.
.
.
+
*
+
*
*
*
*
*
*
.
+
*
.
.
+
.
.
*
+
+
+
*
+
*
*
*
.
.
.
.
.
.
*
*
*
*
.
*
*
*
*
*
.
.
*
*
.
.
.
.
+
*
+
*
*
*
*
*
*
.
+
*
.
.
+
.
.
*
.
.
+
*
+
*
*
*
.
.
.
.
.
.
*
*
*
*
.
*
gltC
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
.
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
.
.
*
*
*
.
*
*
gltX
*
*
*
*
*
*
+
+
*
+
+
+
*
+
+
+
*
*
*
*
*
+
+
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
*
+
+
*
*
*
*
*
*
*
+
*
*
*
*
*
*
glyA
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
gntR
*
*
*
*
*
.
*
*
.
.
.
.
*
*
*
.
*
*
*
*
*
.
+
*
.
.
.
*
*
*
.
.
.
*
*
*
*
*
.
.
.
.
.
.
.
.
.
*
*
+
gntZ
+
.
.
+
.
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
groES
*
*
*
*
*
*
*
+
.
+
*
.
*
*
*
*
+
*
*
+
+
+
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
+
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
gsiB
*
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
*
*
*
.
*
.
.
*
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
*
.
.
.
.
gtaB
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
+
.
+
+
.
+
.
guaA
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
*
+
+
*
*
*
*
*
*
.
+
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
+
+
*
*
*
.
.
.
+
.
+
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
*
+
+
*
*
*
*
*
*
.
+
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
+
+
*
*
*
.
.
.
+
.
+
*
*
*
*
*
*
guaD
No ortholog data.
gutB
*
*
*
*
*
*
*
*
.
+
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
.
+
*
*
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
*
*
*
.
*
*
*
*
*
*
gyrA
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
hbs
*
*
*
*
*
*
*
+
+
+
*
*
.
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
+
+
*
*
*
*
*
*
*
+
*
*
+
*
*
+
hemA
*
*
*
.
.
.
*
+
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
+
.
+
*
.
*
*
*
*
*
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
*
*
.
.
+
*
*
.
*
*
hemZ
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
hrcA
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
.
.
+
+
.
+
+
.
htpG
+
+
+
.
.
.
.
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
.
+
.
+
.
+
+
.
.
+
+
+
+
.
.
+
.
hutP
No ortholog data.
icd
No ortholog data.
ilvB
*
*
*
*
.
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
*
*
*
*
*
*
*
.
.
+
+
+
*
*
*
.
.
.
.
.
.
*
*
*
*
.
*
iolA
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
iolR
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
.
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
iolT
No ortholog data.
kdgR
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
kinC
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
.
*
*
+
*
*
*
*
*
+
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
*
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
.
*
*
.
.
*
.
.
*
.
.
*
*
*
*
*
*
.
.
+
+
.
*
*
*
*
*
.
*
lctE
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
licB
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
licR
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
.
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
lonA
+
+
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
lrpC
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
.
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
lysC
*
*
*
*
.
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
*
+
+
+
*
*
*
+
+
.
.
*
*
*
*
.
+
lytA
No ortholog data.
lytR
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
+
.
+
maeN
No ortholog data.
malA
No ortholog data.
mecA
*
*
.
*
*
*
*
+
.
.
.
.
*
*
*
.
.
.
.
.
.
.
.
*
.
.
.
*
*
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
*
.
med
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
+
+
.
+
.
+
.
+
menB
*
*
*
*
*
*
*
+
*
+
*
.
*
*
+
+
+
+
+
+
*
.
+
*
+
*
.
.
.
*
.
.
.
*
*
*
*
*
.
.
.
.
*
+
*
*
*
*
*
*
menE
*
*
.
*
*
.
+
+
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
.
+
*
*
*
*
*
*
*
.
.
+
*
+
+
*
*
*
*
+
+
.
.
+
*
.
.
.
*
menF
+
.
.
+
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
mtrA
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
nadB
*
*
+
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
*
+
*
*
*
*
+
.
+
*
.
.
*
*
*
*
.
.
.
*
+
.
+
*
.
.
.
.
.
.
*
*
+
.
*
.
nadE
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
nasA
*
*
.
.
.
.
*
.
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
.
*
.
.
*
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
*
*
.
*
.
.
.
.
.
.
.
.
*
.
.
.
nasB
*
+
*
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
*
*
.
*
*
*
*
*
.
.
*
.
.
.
.
.
+
.
.
.
*
+
.
*
*
.
.
.
.
.
.
.
.
*
.
.
.
nfrA
No ortholog data.
nifS
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
+
*
*
*
+
*
+
+
*
*
*
.
*
*
*
*
*
*
+
+
+
*
+
*
*
+
+
*
*
*
*
*
+
*
*
nrgA
*
*
*
*
.
.
*
*
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
+
*
.
.
*
.
.
*
*
+
*
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
nusA
*
+
+
*
*
*
+
+
*
+
+
*
*
+
+
+
+
+
+
+
*
+
+
+
*
+
+
*
+
+
*
*
+
+
+
+
*
+
*
+
*
*
*
*
*
*
+
+
+
*
odhA
*
*
.
.
.
.
*
.
.
.
.
.
+
*
*
*
*
*
*
*
+
+
+
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
+
+
+
+
*
*
*
*
*
.
.
.
.
.
.
.
*
opuA
+
.
.
+
+
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
.
.
+
.
.
.
+
.
.
+
+
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
+
.
+
.
.
+
+
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
opuB
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
.
.
.
+
+
.
.
+
+
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
opuE
+
+
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
+
.
.
+
.
.
.
+
.
pabB
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
pbpD
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
+
*
+
+
*
*
*
*
+
+
*
+
+
+
+
+
+
*
*
.
.
.
.
.
.
*
*
.
+
*
*
pbpE
*
*
*
*
+
+
*
*
.
.
.
.
*
*
*
+
*
*
*
*
*
.
+
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
+
*
*
*
*
*
*
+
+
.
.
*
*
.
.
.
*
pbpF
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
+
*
+
+
*
*
*
*
+
+
*
+
+
+
+
+
+
*
*
.
.
.
.
.
.
*
*
.
+
*
*
pdhA
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
.
.
.
+
pdhC
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
.
.
.
+
perR
+
+
+
+
+
.
+
+
.
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
pgk
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
phoA
*
*
.
.
.
.
*
.
.
.
.
.
*
.
.
.
*
*
*
*
.
.
.
*
.
.
*
.
.
*
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
*
.
*
.
+
phoB
+
+
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
+
.
.
+
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
+
.
+
phoP
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
phrE
No ortholog data.
phrI
No ortholog data.
pmi
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
.
+
ppiB
*
*
*
*
*
*
+
*
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
.
+
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
+
+
*
*
.
.
.
.
+
.
*
*
.
.
*
*
pssA
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
.
+
.
.
.
.
+
.
pta
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
ptsG
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
*
.
*
.
.
.
*
*
*
*
*
+
*
*
.
*
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
*
.
.
.
.
.
*
.
.
.
.
*
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
*
*
*
.
.
.
*
*
*
*
*
+
*
*
.
*
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
*
.
.
.
.
.
*
.
.
.
.
*
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
*
*
*
.
.
.
*
*
*
*
*
+
*
*
*
*
*
.
*
+
*
*
.
*
.
.
+
*
.
.
.
.
.
*
.
.
.
.
*
.
pucA
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
.
.
.
+
+
.
.
+
+
.
.
+
+
pucF
No ortholog data.
pucH
No ortholog data.
pucI
No ortholog data.
pucJ
No ortholog data.
purA
*
*
*
*
*
*
*
+
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
+
+
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
+
+
*
*
.
.
.
.
.
.
*
*
+
*
+
*
purE
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
pyrR
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
qcrA
+
+
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
.
+
rapA
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
rapC
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
rbsR
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
recA
*
*
*
*
*
*
*
+
*
+
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
*
.
+
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
+
+
*
*
*
*
*
*
*
+
*
*
+
+
*
*
resA
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
resD
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
rpmH
*
*
*
*
*
*
+
+
*
+
+
*
+
*
+
*
*
*
*
+
*
+
+
*
*
*
*
*
+
*
*
*
+
.
+
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
.
*
rpoB
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
rpoE
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
rpsD
*
*
*
*
*
*
+
+
*
+
+
*
*
+
+
*
*
*
*
+
*
+
+
+
*
+
*
+
+
*
+
+
+
+
+
+
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
*
*
rrnA-16S
No ortholog data.
rrnB-16S
No ortholog data.
rrnD-16S
No ortholog data.
rrnG-16S
No ortholog data.
rrnO-16S
No ortholog data.
rrnW-16S
No ortholog data.
rsbR
+
+
+
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
+
.
.
+
+
+
.
+
+
.
+
+
+
sacX
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
*
.
*
.
.
.
*
*
*
*
*
+
*
*
.
*
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
*
.
.
.
.
.
*
.
.
.
.
*
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
*
*
*
.
.
.
*
*
*
*
*
+
*
*
.
*
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
*
.
.
.
.
.
*
.
.
.
.
*
.
scr
No ortholog data.
sdhC
+
+
+
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
.
+
+
+
sigD
*
*
*
.
.
.
*
+
.
.
.
.
.
+
+
.
*
*
*
*
*
.
+
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
*
*
*
.
+
*
+
+
.
.
sigH
+
+
+
+
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
.
+
+
.
+
+
+
sigI
No ortholog data.
sigX
+
+
+
+
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
.
+
+
.
+
+
+
sinI
No ortholog data.
sinR
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
sipS
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
speD
No ortholog data.
spo0A
*
*
*
.
.
.
.
*
.
.
.
.
.
*
+
.
*
*
*
*
*
.
*
*
+
*
*
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
*
.
*
.
*
spo0B
No ortholog data.
spo0E
No ortholog data.
spo0F
*
*
*
.
.
.
.
*
.
.
.
.
.
*
+
.
*
*
*
*
*
.
*
*
+
*
*
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
*
.
*
.
*
spoIIE
*
*
*
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
*
*
.
.
.
.
.
.
.
+
*
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
*
.
+
.
.
.
*
*
*
.
*
*
.
+
*
.
spoIIGA
No ortholog data.
srfAA
*
.
.
*
*
+
*
+
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
.
+
*
.
.
.
.
.
*
.
.
*
*
.
+
*
.
.
.
.
.
.
.
.
*
.
.
.
.
tagA
+
.
+
+
.
.
+
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
.
+
+
+
+
.
+
tagC
No ortholog data.
tagD
+
.
.
+
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
tetL
No ortholog data.
thrS
*
*
*
*
*
*
+
+
+
+
+
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
*
*
*
*
*
*
+
*
*
*
+
+
+
+
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
treP
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
+
.
trpE
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
+
+
*
*
*
.
.
.
.
.
.
*
*
*
+
+
*
trxA
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
tyrS
*
*
*
*
*
*
*
+
+
+
+
*
+
+
*
+
*
*
*
*
+
+
+
*
*
*
*
*
*
*
+
+
+
+
+
+
*
*
*
+
*
*
*
+
*
*
*
+
*
*
ureA
+
+
.
.
.
.
+
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
+
+
+
.
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
+
+
.
.
.
+
valS
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
veg
*
*
*
*
+
+
+
*
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
wapA
+
.
+
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
xpt
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
+
+
+
xsa
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
xylA
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
.
+
+
.
+
.
.
xylR
*
*
*
*
*
*
*
*
*
.
.
.
*
*
*
+
*
*
*
*
*
.
+
.
*
*
.
.
.
.
.
.
.
*
*
*
*
*
.
.
.
.
.
*
*
*
+
*
*
*
xynP
No ortholog data.
yaaA
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
+
+
+
yaaB
No ortholog data.
ybbB
*
*
*
*
+
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
.
*
*
*
*
.
*
*
*
*
*
+
*
*
*
*
*
.
.
.
.
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
.
*
*
*
.
.
.
.
*
*
*
.
*
*
*
*
*
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
+
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
yccC
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
ycdH
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
.
.
.
+
+
.
.
+
+
+
.
+
+
.
.
.
+
+
+
.
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
yciA
+
+
.
.
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
.
yciC
+
+
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
yczA
No ortholog data.
yfmP
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
yhaG
No ortholog data.
yjcI
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
yjmA
+
+
+
+
.
.
.
+
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
+
.
.
.
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
.
yklA
+
.
.
+
.
.
+
+
.
+
+
.
+
.
.
.
+
+
+
.
+
.
+
+
.
.
+
.
.
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
ykoL
No ortholog data.
ykuN
*
.
*
*
*
*
.
*
.
.
.
.
.
.
.
.
*
*
*
*
*
+
+
*
*
*
*
.
.
*
*
*
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
*
.
*
*
.
.
*
.
ykvW
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
ylxM
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
yneI
+
+
+
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
+
+
.
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
.
+
.
+
yneJ
+
+
+
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
+
ypuE
No ortholog data.
yqxD
+
+
+
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
+
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
.
.
.
.
.
.
ytkD
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
ytrA
+
+
+
.
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
+
.
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
.
+
.
.
yuiI
*
*
*
*
+
*
*
+
.
.
.
.
*
+
*
+
*
*
*
*
+
.
+
*
+
*
.
*
+
+
.
.
*
+
+
*
*
*
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
*
yuxH
*
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
+
.
.
.
yvgR
+
+
+
.
.
.
+
+
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
.
.
.
+
+
+
+
+
.
.
+
+
.
.
+
+
.
.
+
+
ywbI
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
ywfK
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
+
+
+
+
+
+
+
+
+
.
+
+
+
+
+
+
+
+
.
.
+
+
+
+
+
+
.
.
.
.
.
.
+
+
+
.
+
+
Copyright:
Human Genome Center
, Inst. Med. Sci., Univ. Tokyo; 1999-2004
Contact: knakai@ims.u-tokyo.ac.jp